69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3561 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 2178 aa  4318    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  70 
 
 		 577 aa  629  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  43.13 
 
 		 1538 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1284 aa  134  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  35.56 
 
 		 2026 aa  113  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  35.75 
 
 		 1438 aa  109  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  55.14 
 
 		 1537 aa  107  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  36.18 
 
 		 549 aa  103  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  40 
 
 		 2499 aa  102  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  32.57 
 
 		 1141 aa  98.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  53.08 
 
 		 1439 aa  94  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  52 
 
 		 777 aa  92.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  44.72 
 
 		 1496 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  30.92 
 
 		 2912 aa  90.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  42.86 
 
 		 2192 aa  88.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  48.89 
 
 		 916 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  41.22 
 
 		 2002 aa  84  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.38 
 
 		 1096 aa  83.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  46.28 
 
 		 675 aa  78.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  29.25 
 
 		 2803 aa  77.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  29.08 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  50.93 
 
 		 827 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1289 aa  62.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  27.79 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1752 aa  61.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.29 
 
 		 939 aa  61.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.67 
 
 		 1686 aa  61.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.38 
 
 		 1047 aa  61.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.83 
 
 		 2456 aa  61.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  42.33 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  43.16 
 
 		 2337 aa  57.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  42.57 
 
 		 1728 aa  57.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  43.68 
 
 		 331 aa  57.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  30.11 
 
 		 3925 aa  57.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1781 aa  55.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.97 
 
 		 2625 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.85 
 
 		 1627 aa  55.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  22.81 
 
 		 1224 aa  53.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  31.72 
 
 		 1199 aa  54.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  35.04 
 
 		 2117 aa  53.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  33.95 
 
 		 2135 aa  52.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.18 
 
 		 1590 aa  52.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  27.41 
 
 		 2927 aa  52  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  36.11 
 
 		 730 aa  52  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1026 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  33.9 
 
 		 665 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  31.22 
 
 		 1691 aa  51.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.15 
 
 		 1332 aa  50.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  32.89 
 
 		 635 aa  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1838 aa  49.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.3 
 
 		 3323 aa  49.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.57 
 
 		 4761 aa  49.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  27.64 
 
 		 1672 aa  49.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  30.84 
 
 		 352 aa  49.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  27.49 
 
 		 1596 aa  48.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0621  fibronectin, type III domain-containing protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0839934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  32.99 
 
 		 665 aa  48.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  33.6 
 
 		 656 aa  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.74 
 
 		 4480 aa  47.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  26.88 
 
 		 1428 aa  47.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.79 
 
 		 655 aa  47.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  40.86 
 
 		 868 aa  46.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  25 
 
 		 2222 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  36.04 
 
 		 767 aa  46.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  28.02 
 
 		 1521 aa  46.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  29.89 
 
 		 955 aa  46.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1762 aa  45.8  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  32 
 
 		 455 aa  45.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  32 
 
 		 455 aa  45.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>