156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1673 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  100 
 
 
1428 aa  2819    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  74.25 
 
 
1424 aa  1932    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  44.19 
 
 
894 aa  281  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  39.01 
 
 
894 aa  271  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  34.82 
 
 
1057 aa  180  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.06 
 
 
1053 aa  168  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  33.52 
 
 
618 aa  166  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  39.51 
 
 
1762 aa  164  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  32.17 
 
 
1061 aa  155  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  33.64 
 
 
617 aa  152  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  30.66 
 
 
1073 aa  152  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  28.47 
 
 
1034 aa  144  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  47.92 
 
 
716 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  42.6 
 
 
913 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.77 
 
 
3227 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  29.42 
 
 
5743 aa  107  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  53.66 
 
 
978 aa  97.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.52 
 
 
1332 aa  95.1  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.29 
 
 
3325 aa  91.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  35.04 
 
 
852 aa  89.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  32.91 
 
 
373 aa  88.2  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  25.63 
 
 
1157 aa  85.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  28.1 
 
 
1902 aa  85.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  46.32 
 
 
1167 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  44.06 
 
 
3699 aa  84  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  25.05 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  30.72 
 
 
675 aa  82.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.06 
 
 
3699 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  28.67 
 
 
531 aa  81.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  43.36 
 
 
2503 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  25.32 
 
 
1825 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  46.21 
 
 
3544 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  26.93 
 
 
3824 aa  76.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.69 
 
 
1212 aa  76.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  28.45 
 
 
3734 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.21 
 
 
1001 aa  74.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  26.38 
 
 
3721 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  26.86 
 
 
3824 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.52 
 
 
3586 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  21.46 
 
 
2552 aa  73.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.17 
 
 
3739 aa  73.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  26.17 
 
 
3824 aa  72.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.17 
 
 
4106 aa  72.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.54 
 
 
1224 aa  72.4  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  29.74 
 
 
3736 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  39.3 
 
 
2927 aa  70.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.52 
 
 
1109 aa  70.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  41.28 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  38.46 
 
 
1193 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.08 
 
 
3552 aa  68.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2584  hypothetical protein  43.96 
 
 
793 aa  68.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161987  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  29.72 
 
 
513 aa  67.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.92 
 
 
2522 aa  65.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  22.52 
 
 
1570 aa  65.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.53 
 
 
1695 aa  65.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 
2704 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  45.19 
 
 
2802 aa  65.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.2 
 
 
1919 aa  64.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.08 
 
 
1219 aa  64.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  36.19 
 
 
1303 aa  62.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  40.79 
 
 
1736 aa  62  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.03 
 
 
616 aa  62  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.16 
 
 
1047 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  27.02 
 
 
1278 aa  61.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30.26 
 
 
3562 aa  61.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.86 
 
 
4874 aa  60.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  29.74 
 
 
1096 aa  60.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.33 
 
 
1073 aa  59.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  22.37 
 
 
744 aa  58.9  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  31.82 
 
 
586 aa  58.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.21 
 
 
2715 aa  58.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 
2886 aa  58.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  32.03 
 
 
562 aa  58.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  27.24 
 
 
4689 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  36.09 
 
 
1029 aa  57.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.6 
 
 
3089 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  22.89 
 
 
1570 aa  57  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  26.75 
 
 
1951 aa  57.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  40 
 
 
354 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.73 
 
 
1004 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  36.84 
 
 
518 aa  57  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5090  hypothetical protein  30.77 
 
 
467 aa  57  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  45.16 
 
 
560 aa  56.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  37.23 
 
 
529 aa  56.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  27.46 
 
 
1141 aa  55.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  29.95 
 
 
739 aa  55.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  37.14 
 
 
756 aa  55.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.41 
 
 
726 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.06 
 
 
2528 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  37.36 
 
 
346 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  24.82 
 
 
2117 aa  53.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  35.92 
 
 
3802 aa  53.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  31.06 
 
 
812 aa  54.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.65 
 
 
828 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  20.13 
 
 
6885 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  28.86 
 
 
2082 aa  53.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.16 
 
 
5216 aa  52.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
1083 aa  53.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  26.69 
 
 
916 aa  52.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  47.92 
 
 
837 aa  52.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>