More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1123 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  100 
 
 
1570 aa  3123    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  98.03 
 
 
1570 aa  3070    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.47 
 
 
1776 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  34.75 
 
 
1962 aa  472  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  32.51 
 
 
1809 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  34.11 
 
 
2042 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  31.17 
 
 
1570 aa  321  6e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  34.68 
 
 
1618 aa  313  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0676  proteinase, putative  31.98 
 
 
885 aa  267  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  28.78 
 
 
1233 aa  255  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.28 
 
 
891 aa  251  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.86 
 
 
883 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
860 aa  211  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 
860 aa  207  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  29.86 
 
 
1406 aa  195  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  30.06 
 
 
1407 aa  192  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  29.91 
 
 
1407 aa  190  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  29.91 
 
 
1407 aa  190  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  29.94 
 
 
917 aa  185  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  29.94 
 
 
917 aa  185  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  29.65 
 
 
917 aa  183  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  28.91 
 
 
917 aa  184  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  29.54 
 
 
917 aa  183  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  28.91 
 
 
917 aa  182  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  28.43 
 
 
917 aa  181  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  28.69 
 
 
917 aa  180  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  30.38 
 
 
917 aa  179  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 
915 aa  170  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
1323 aa  163  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.75 
 
 
1124 aa  161  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 
660 aa  152  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  25.13 
 
 
1725 aa  146  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  26.29 
 
 
1042 aa  143  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
728 aa  140  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.24 
 
 
1234 aa  135  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.73 
 
 
1283 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.47 
 
 
1293 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  25.72 
 
 
1321 aa  133  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.68 
 
 
1474 aa  132  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  25.22 
 
 
1639 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.68 
 
 
1286 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.77 
 
 
1215 aa  127  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.75 
 
 
1565 aa  127  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.48 
 
 
1092 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  27.55 
 
 
1300 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 
1638 aa  123  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.58 
 
 
1212 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  26.71 
 
 
1300 aa  122  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.46 
 
 
1638 aa  122  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  24.64 
 
 
1739 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  23.55 
 
 
1116 aa  119  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  24.61 
 
 
1258 aa  119  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  23.81 
 
 
1638 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  23.55 
 
 
1705 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  23.55 
 
 
1705 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 
1648 aa  116  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.86 
 
 
1705 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 
1669 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  23.64 
 
 
1683 aa  115  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.96 
 
 
1648 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.96 
 
 
1648 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.22 
 
 
1706 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.32 
 
 
1292 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  24.92 
 
 
1634 aa  112  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.74 
 
 
1649 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.79 
 
 
1220 aa  110  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  24.17 
 
 
1265 aa  110  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  29.58 
 
 
1035 aa  109  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  23.89 
 
 
1115 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30.53 
 
 
5743 aa  107  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.01 
 
 
1075 aa  106  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  27.52 
 
 
1298 aa  107  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  27.34 
 
 
1298 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
1212 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  27.34 
 
 
1298 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
1212 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
1212 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  27.52 
 
 
1298 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  24.96 
 
 
1287 aa  102  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.49 
 
 
627 aa  102  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.44 
 
 
1199 aa  101  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  26.7 
 
 
983 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  25.18 
 
 
971 aa  100  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.05 
 
 
1099 aa  99.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.03 
 
 
1659 aa  98.6  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.49 
 
 
1645 aa  98.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  23.51 
 
 
1109 aa  94.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 
490 aa  92  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.35 
 
 
2552 aa  91.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.46 
 
 
1160 aa  91.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  23.43 
 
 
994 aa  91.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
1383 aa  90.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  24.94 
 
 
789 aa  90.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.48 
 
 
1649 aa  89.4  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.53 
 
 
1312 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  25.54 
 
 
1312 aa  86.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.16 
 
 
495 aa  85.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  23.6 
 
 
950 aa  85.5  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>