More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01952 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.99 
 
 
1283 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.68 
 
 
1286 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  100 
 
 
1321 aa  2674    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.77 
 
 
1292 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  36.42 
 
 
1035 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  31.55 
 
 
1109 aa  362  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.55 
 
 
1293 aa  279  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.35 
 
 
1099 aa  278  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  29.33 
 
 
1099 aa  274  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  31.99 
 
 
1300 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  31.53 
 
 
1298 aa  271  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  29.18 
 
 
1258 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  31.03 
 
 
1298 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  30.91 
 
 
1298 aa  265  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.4 
 
 
1474 aa  264  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 
728 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  30.44 
 
 
1300 aa  261  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  32.02 
 
 
1042 aa  259  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  30.91 
 
 
1298 aa  259  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  28.66 
 
 
1265 aa  251  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  27.53 
 
 
1115 aa  243  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  27.12 
 
 
1116 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.69 
 
 
1160 aa  238  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 
1199 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  33.72 
 
 
983 aa  231  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  28.45 
 
 
1287 aa  231  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  29.21 
 
 
917 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  29.21 
 
 
917 aa  222  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  28.88 
 
 
917 aa  221  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  29.03 
 
 
917 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  26.91 
 
 
1634 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  28.44 
 
 
917 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  28.7 
 
 
917 aa  215  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.6 
 
 
915 aa  214  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  28.57 
 
 
917 aa  214  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.85 
 
 
1312 aa  211  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  28.72 
 
 
917 aa  211  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  28.72 
 
 
917 aa  211  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  29.06 
 
 
1739 aa  210  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.47 
 
 
1648 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 
1645 aa  206  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.47 
 
 
1648 aa  206  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.76 
 
 
1000 aa  205  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.66 
 
 
1648 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  28.43 
 
 
1406 aa  204  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  29.09 
 
 
971 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  28.1 
 
 
1639 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.01 
 
 
1312 aa  201  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
1649 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.63 
 
 
1659 aa  193  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  27.98 
 
 
1725 aa  191  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  30.43 
 
 
994 aa  188  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.39 
 
 
1669 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 
1706 aa  186  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  27.07 
 
 
1705 aa  185  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  27.07 
 
 
1705 aa  185  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  27.4 
 
 
1406 aa  184  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  27.03 
 
 
1407 aa  183  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.45 
 
 
1407 aa  183  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  27.03 
 
 
1407 aa  183  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 
1638 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  28.64 
 
 
1006 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  26.62 
 
 
1638 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.54 
 
 
1638 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  27.25 
 
 
1109 aa  174  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29 
 
 
891 aa  163  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
1649 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
1323 aa  157  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.12 
 
 
1124 aa  157  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.33 
 
 
1092 aa  155  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 
1399 aa  154  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  28.4 
 
 
1045 aa  154  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  28.74 
 
 
1220 aa  152  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  26.59 
 
 
1683 aa  152  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 
860 aa  145  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  28.71 
 
 
1618 aa  142  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.07 
 
 
1570 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.93 
 
 
1570 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.91 
 
 
660 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
1776 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 
1212 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.82 
 
 
1383 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.57 
 
 
1234 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.09 
 
 
1809 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  26.7 
 
 
1215 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.03 
 
 
883 aa  129  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.67 
 
 
860 aa  128  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1212 aa  121  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1212 aa  121  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.58 
 
 
1212 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26.3 
 
 
1962 aa  119  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  36.42 
 
 
235 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  26.91 
 
 
1570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.31 
 
 
1565 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  24.96 
 
 
2042 aa  109  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  28.38 
 
 
1221 aa  107  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37 
 
 
1060 aa  106  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 
1075 aa  105  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.81 
 
 
962 aa  101  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  38.33 
 
 
1324 aa  94  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>