More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6015 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.71 
 
 
1075 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1092 aa  2183    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.71 
 
 
1234 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.61 
 
 
1383 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  39.25 
 
 
1221 aa  568  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.21 
 
 
1323 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.75 
 
 
1191 aa  222  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.99 
 
 
1049 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  28.66 
 
 
1220 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.2 
 
 
1191 aa  195  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  28.36 
 
 
1215 aa  173  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 
1212 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
1212 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.6 
 
 
891 aa  162  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
883 aa  162  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
1212 aa  161  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
1212 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.47 
 
 
917 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  25.99 
 
 
917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.67 
 
 
917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  25.99 
 
 
917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.55 
 
 
860 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.97 
 
 
917 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.1 
 
 
917 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.18 
 
 
860 aa  147  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.3 
 
 
915 aa  147  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  27.59 
 
 
917 aa  147  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  26.07 
 
 
917 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  26.28 
 
 
917 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  28.55 
 
 
1407 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  28.55 
 
 
1407 aa  139  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  28.38 
 
 
1406 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  28.13 
 
 
1321 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.21 
 
 
1407 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
728 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  28.03 
 
 
1809 aa  127  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  27.21 
 
 
1962 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.7 
 
 
1199 aa  118  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.94 
 
 
1570 aa  118  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.88 
 
 
1570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
1283 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.73 
 
 
1645 aa  109  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.1 
 
 
1776 aa  108  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  29.03 
 
 
1265 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 
1399 aa  105  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  28.57 
 
 
1312 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  28.68 
 
 
1099 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  27.63 
 
 
1638 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.54 
 
 
1312 aa  101  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  28.07 
 
 
983 aa  101  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  28.08 
 
 
1109 aa  101  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  28.86 
 
 
1287 aa  99.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  27.99 
 
 
1300 aa  99.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 
1648 aa  97.8  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  26.92 
 
 
1258 aa  97.8  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 
1638 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 
1648 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.36 
 
 
1565 aa  96.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.97 
 
 
1648 aa  97.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  27.84 
 
 
1634 aa  96.3  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.77 
 
 
1292 aa  95.5  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.96 
 
 
1669 aa  95.1  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  28.04 
 
 
1115 aa  94.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.76 
 
 
1638 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  27.08 
 
 
1739 aa  93.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.71 
 
 
1124 aa  93.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.94 
 
 
1286 aa  92.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.95 
 
 
1035 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  25.5 
 
 
1705 aa  92.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  25.5 
 
 
1705 aa  92.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.62 
 
 
660 aa  90.9  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  24.26 
 
 
1570 aa  89.7  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  28.21 
 
 
1298 aa  89.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  28.59 
 
 
1298 aa  89.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  26.32 
 
 
2042 aa  89.4  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  27.59 
 
 
1298 aa  89  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  26.7 
 
 
1116 aa  89  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  28.21 
 
 
1298 aa  88.2  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
1293 aa  87.8  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  28.68 
 
 
1045 aa  87  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  31.38 
 
 
950 aa  85.9  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  25.78 
 
 
1042 aa  85.9  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  27.41 
 
 
1300 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.65 
 
 
1099 aa  85.9  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  27.01 
 
 
1109 aa  85.5  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 
1649 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
1160 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.52 
 
 
1659 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.02 
 
 
1618 aa  84  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.77 
 
 
1706 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.39 
 
 
1705 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  29.03 
 
 
971 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  31.9 
 
 
1639 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2567  protease CspB  24.54 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  28.65 
 
 
1006 aa  79  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
1000 aa  78.2  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  24.96 
 
 
1725 aa  77  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  37.42 
 
 
1324 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
1474 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0556  hypothetical protein  33.47 
 
 
1261 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.170539  normal  0.101449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>