233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2274 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  100 
 
 
1115 aa  2252    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  42.95 
 
 
1099 aa  703    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  89.16 
 
 
1116 aa  2008    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.11 
 
 
1099 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  32.59 
 
 
1109 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  36.64 
 
 
983 aa  357  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  34.93 
 
 
1406 aa  346  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  39.37 
 
 
1312 aa  334  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  33.82 
 
 
1265 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  35.96 
 
 
1258 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  34.69 
 
 
1042 aa  326  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.36 
 
 
1474 aa  322  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.93 
 
 
1648 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.93 
 
 
1648 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.77 
 
 
1648 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.4 
 
 
1645 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.49 
 
 
1000 aa  296  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  36.89 
 
 
1725 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.55 
 
 
1283 aa  290  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  36.01 
 
 
1634 aa  290  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  36.49 
 
 
1006 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.96 
 
 
1199 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  38.63 
 
 
1109 aa  282  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  33.49 
 
 
1287 aa  279  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.81 
 
 
1659 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  34.14 
 
 
994 aa  278  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  34.19 
 
 
1045 aa  278  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.19 
 
 
1312 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.86 
 
 
1649 aa  272  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  35.58 
 
 
971 aa  269  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  33.06 
 
 
1300 aa  267  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  32.84 
 
 
1298 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  33.01 
 
 
1298 aa  264  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  34.29 
 
 
1300 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.09 
 
 
1293 aa  262  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  33.85 
 
 
1739 aa  262  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  32.87 
 
 
1298 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  32.87 
 
 
1298 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.8 
 
 
1706 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.28 
 
 
1286 aa  249  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.89 
 
 
1669 aa  248  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.13 
 
 
1292 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  33.13 
 
 
1639 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  30.21 
 
 
1705 aa  238  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  32.36 
 
 
1705 aa  238  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.07 
 
 
1649 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.83 
 
 
1399 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.6 
 
 
1638 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.32 
 
 
1705 aa  233  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.6 
 
 
1638 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  31.81 
 
 
1638 aa  231  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  33.08 
 
 
1683 aa  226  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  27.18 
 
 
1321 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.45 
 
 
1035 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.03 
 
 
1160 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.68 
 
 
728 aa  169  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  25.89 
 
 
917 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  25.75 
 
 
917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  25.93 
 
 
917 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  25.75 
 
 
917 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  25.78 
 
 
917 aa  146  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  25.25 
 
 
917 aa  147  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  25.25 
 
 
917 aa  147  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.25 
 
 
917 aa  147  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  25.25 
 
 
917 aa  147  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  27.54 
 
 
1406 aa  145  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  27.45 
 
 
1407 aa  144  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  26.36 
 
 
1407 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  27.45 
 
 
1407 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.57 
 
 
915 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.56 
 
 
962 aa  118  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.92 
 
 
891 aa  117  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.33 
 
 
1124 aa  114  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.29 
 
 
860 aa  112  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.49 
 
 
1776 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 
660 aa  105  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  26.35 
 
 
1221 aa  103  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
1092 aa  99.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.75 
 
 
1618 aa  99  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  33.46 
 
 
1333 aa  95.9  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  26.75 
 
 
1570 aa  93.6  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.51 
 
 
1570 aa  94  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
1323 aa  93.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.59 
 
 
1570 aa  92.8  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.15 
 
 
1809 aa  91.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.54 
 
 
1060 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  24.41 
 
 
1220 aa  88.2  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.17 
 
 
1383 aa  87  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
1234 aa  86.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.86 
 
 
1212 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.24 
 
 
860 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.32 
 
 
1239 aa  82  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  24.23 
 
 
1215 aa  77  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  23.45 
 
 
1962 aa  77  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  23.3 
 
 
2042 aa  77.4  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  41.18 
 
 
1324 aa  76.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.34 
 
 
1253 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.59 
 
 
1212 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.46 
 
 
1049 aa  74.7  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  33.82 
 
 
1285 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>