More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0392 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.71 
 
 
1092 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1075 aa  2057    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.61 
 
 
1383 aa  505  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.77 
 
 
1234 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  34.97 
 
 
1221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.99 
 
 
1323 aa  432  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.88 
 
 
1191 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.08 
 
 
1220 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.69 
 
 
883 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.63 
 
 
1212 aa  173  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  26.6 
 
 
1215 aa  171  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.87 
 
 
891 aa  161  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.99 
 
 
1191 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 
860 aa  154  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.77 
 
 
1212 aa  152  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
1212 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.59 
 
 
1212 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  26.99 
 
 
1407 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  26.99 
 
 
1407 aa  149  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  26.6 
 
 
1406 aa  146  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.39 
 
 
917 aa  145  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  26.06 
 
 
917 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.47 
 
 
915 aa  144  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  26.06 
 
 
917 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.39 
 
 
917 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.3 
 
 
1049 aa  144  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  25.03 
 
 
917 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  26.37 
 
 
917 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  25.71 
 
 
917 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.22 
 
 
917 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  24.75 
 
 
917 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  26.89 
 
 
1407 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.34 
 
 
860 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.58 
 
 
1706 aa  121  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.77 
 
 
728 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.8 
 
 
1283 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1669 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  25.07 
 
 
1321 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  25.76 
 
 
1705 aa  104  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.84 
 
 
1705 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  25.65 
 
 
1705 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  25.79 
 
 
1265 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  25.18 
 
 
1638 aa  102  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  26.08 
 
 
1683 aa  101  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.96 
 
 
1570 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  27.91 
 
 
1099 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.82 
 
 
660 aa  99.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.92 
 
 
1570 aa  99.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.17 
 
 
1659 aa  99.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.05 
 
 
1199 aa  99  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  24.85 
 
 
1570 aa  98.2  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.83 
 
 
1776 aa  97.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.18 
 
 
1649 aa  97.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  26.07 
 
 
1739 aa  96.3  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  26.23 
 
 
1042 aa  94.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  27.35 
 
 
1258 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26.31 
 
 
1962 aa  94  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.86 
 
 
1618 aa  92  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  28.92 
 
 
983 aa  90.9  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.17 
 
 
1645 aa  90.9  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  29.13 
 
 
1035 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
1286 aa  89.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.6 
 
 
1399 aa  90.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.81 
 
 
1124 aa  88.2  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
1099 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  34.48 
 
 
950 aa  87.8  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
1649 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 
1474 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 
1312 aa  85.5  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  27.31 
 
 
1809 aa  85.5  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  23.9 
 
 
2042 aa  85.1  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  40 
 
 
1239 aa  83.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.71 
 
 
1293 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.38 
 
 
1060 aa  82.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.27 
 
 
1253 aa  80.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.42 
 
 
1648 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  25.54 
 
 
1300 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  24.49 
 
 
1300 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.1 
 
 
1160 aa  79.7  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
1292 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 
1648 aa  79  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
1648 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  31.98 
 
 
1406 aa  74.7  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  25.53 
 
 
1725 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
1000 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.73 
 
 
412 aa  72  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.14 
 
 
1078 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  31.56 
 
 
535 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  45.68 
 
 
1287 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4602  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  41.22 
 
 
1340 aa  68.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823259  normal  0.0573734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  27.69 
 
 
971 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  39.18 
 
 
1324 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  32.04 
 
 
485 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.17 
 
 
576 aa  66.6  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  29.72 
 
 
1639 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  31.08 
 
 
801 aa  67  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.32 
 
 
805 aa  66.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.93 
 
 
540 aa  66.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
848 aa  66.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  36.71 
 
 
1333 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>