241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3335 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3335  serine protease  100 
 
 
983 aa  1986    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  35.77 
 
 
1042 aa  465  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  37 
 
 
1312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  34.77 
 
 
971 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  34.25 
 
 
1006 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.22 
 
 
1099 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  37.44 
 
 
1099 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.03 
 
 
1000 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  33.5 
 
 
1109 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  33.2 
 
 
994 aa  368  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  32.49 
 
 
1045 aa  363  8e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  36.5 
 
 
1115 aa  352  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  36.1 
 
 
1116 aa  348  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  31.56 
 
 
1265 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
1474 aa  333  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  31.63 
 
 
1258 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  33.73 
 
 
1109 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.13 
 
 
1399 aa  282  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  31 
 
 
1406 aa  271  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.02 
 
 
1199 aa  269  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.33 
 
 
1645 aa  267  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.99 
 
 
1649 aa  264  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.52 
 
 
1648 aa  264  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.64 
 
 
1648 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.76 
 
 
1293 aa  262  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  31.94 
 
 
1634 aa  258  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
1648 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  30.45 
 
 
1287 aa  255  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.37 
 
 
1659 aa  255  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  29.96 
 
 
1300 aa  252  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  29.41 
 
 
1300 aa  250  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  30.52 
 
 
1725 aa  250  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
1312 aa  249  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.63 
 
 
1649 aa  247  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  29.57 
 
 
1298 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  29.81 
 
 
1298 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  29.58 
 
 
1298 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  29.58 
 
 
1298 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  28.88 
 
 
1739 aa  228  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
1283 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  33.99 
 
 
1321 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  31.62 
 
 
1705 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  31.62 
 
 
1705 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.58 
 
 
1669 aa  211  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 
1706 aa  211  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.33 
 
 
1286 aa  206  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  27.64 
 
 
1638 aa  204  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  32.28 
 
 
1683 aa  200  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  28.25 
 
 
1639 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.76 
 
 
1705 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.33 
 
 
1292 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
1638 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
1638 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  31.43 
 
 
1406 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  30.62 
 
 
1407 aa  180  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  30.8 
 
 
1407 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  30.8 
 
 
1407 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 
728 aa  162  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  29.93 
 
 
1035 aa  151  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  31.8 
 
 
962 aa  146  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.44 
 
 
915 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 
1160 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.72 
 
 
917 aa  139  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  27.63 
 
 
917 aa  138  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  26.59 
 
 
917 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.58 
 
 
917 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.56 
 
 
917 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  27.79 
 
 
917 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  26.41 
 
 
917 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  26.32 
 
 
917 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  26.32 
 
 
917 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 
1124 aa  116  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 
1565 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.13 
 
 
891 aa  114  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  29.28 
 
 
1221 aa  107  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.56 
 
 
660 aa  100  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  25.43 
 
 
2042 aa  100  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.85 
 
 
1234 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
860 aa  99.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.63 
 
 
1215 aa  98.2  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.76 
 
 
1776 aa  98.2  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.28 
 
 
1220 aa  96.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.07 
 
 
1092 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  27.88 
 
 
1570 aa  89.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
1212 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
1212 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 
883 aa  89.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 
1323 aa  89  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  26.56 
 
 
1570 aa  88.6  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
1212 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.25 
 
 
1809 aa  87.4  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 
1383 aa  85.9  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  26.34 
 
 
1570 aa  84.7  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 
860 aa  84  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.43 
 
 
1212 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26.85 
 
 
1962 aa  84.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
1060 aa  81.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.39 
 
 
1618 aa  80.9  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  27.92 
 
 
1233 aa  77.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  48.28 
 
 
1239 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>