233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1500 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  66.82 
 
 
1298 aa  1756    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  66.67 
 
 
1298 aa  1750    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  64.45 
 
 
1300 aa  1710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1293 aa  2647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  66.74 
 
 
1298 aa  1755    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.51 
 
 
1474 aa  828    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  39.52 
 
 
1258 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  65.85 
 
 
1300 aa  1756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  66.82 
 
 
1298 aa  1752    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  39.97 
 
 
1265 aa  844    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.13 
 
 
1312 aa  563  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  33.17 
 
 
1287 aa  555  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  39.98 
 
 
1634 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.97 
 
 
1659 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.83 
 
 
1645 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.28 
 
 
1705 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.28 
 
 
1669 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  38.63 
 
 
1683 aa  486  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.4 
 
 
1649 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.73 
 
 
1648 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.73 
 
 
1648 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.73 
 
 
1648 aa  482  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.9 
 
 
1706 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  32.24 
 
 
1739 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  33.22 
 
 
1705 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  33.22 
 
 
1705 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  35.16 
 
 
1639 aa  476  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
1399 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.36 
 
 
1649 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.95 
 
 
1638 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  31.63 
 
 
1638 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.13 
 
 
1638 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.79 
 
 
1199 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  37.83 
 
 
1725 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  32.19 
 
 
1109 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  30.17 
 
 
1406 aa  351  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.93 
 
 
1283 aa  325  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.6 
 
 
1292 aa  302  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.86 
 
 
1286 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  29.32 
 
 
1042 aa  275  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
1099 aa  273  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.95 
 
 
1312 aa  265  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  30.01 
 
 
1099 aa  264  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  29.76 
 
 
983 aa  263  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  35.42 
 
 
1115 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  34.28 
 
 
1116 aa  252  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  29.77 
 
 
1321 aa  249  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  36.3 
 
 
1035 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.35 
 
 
1000 aa  239  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  28.53 
 
 
994 aa  230  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  30.49 
 
 
971 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  27.54 
 
 
1045 aa  209  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  27.26 
 
 
1006 aa  203  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  27.81 
 
 
1109 aa  201  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 
1160 aa  193  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
891 aa  154  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.78 
 
 
728 aa  154  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  30.66 
 
 
1618 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  25.77 
 
 
1406 aa  145  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  28.7 
 
 
1570 aa  142  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  26.14 
 
 
1407 aa  141  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.61 
 
 
962 aa  139  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  25.97 
 
 
1407 aa  138  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  25.97 
 
 
1407 aa  138  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.69 
 
 
860 aa  125  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  25.87 
 
 
2042 aa  124  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  24.71 
 
 
1809 aa  121  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.43 
 
 
915 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  26.86 
 
 
1570 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  24.07 
 
 
917 aa  116  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  24.46 
 
 
917 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.47 
 
 
1570 aa  115  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  24.15 
 
 
917 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  23.99 
 
 
917 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  23.91 
 
 
917 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  23.99 
 
 
917 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 
660 aa  112  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  23.48 
 
 
917 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.54 
 
 
1124 aa  108  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  23.46 
 
 
917 aa  108  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  23.31 
 
 
917 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.13 
 
 
1323 aa  105  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.64 
 
 
1565 aa  103  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  25.66 
 
 
1962 aa  100  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.65 
 
 
1234 aa  96.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  26.94 
 
 
1233 aa  93.2  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
1212 aa  92  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.9 
 
 
860 aa  91.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.29 
 
 
1383 aa  90.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.83 
 
 
1776 aa  90.1  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  23.16 
 
 
1220 aa  90.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  26.81 
 
 
1221 aa  87  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.41 
 
 
1092 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  24.02 
 
 
1215 aa  87  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  31.93 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 
1191 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  39.23 
 
 
1393 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  39.29 
 
 
1393 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 
1191 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.91 
 
 
1060 aa  67.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>