126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3141 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  100 
 
 		 1393 aa  2855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  93.61 
 
 		 1393 aa  2650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  54.12 
 
 		 1311 aa  1352    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  35.81 
 
 		 887 aa  269  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  33.68 
 
 		 935 aa  250  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  35.29 
 
 		 730 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  30.38 
 
 		 927 aa  241  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  36.54 
 
 		 730 aa  228  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  36.23 
 
 		 730 aa  226  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  34.11 
 
 		 950 aa  179  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  39.66 
 
 		 3278 aa  130  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  37.25 
 
 		 656 aa  117  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  28.75 
 
 		 839 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  39.25 
 
 		 901 aa  99.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  40.62 
 
 		 831 aa  99.4  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  39.89 
 
 		 902 aa  99.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.62 
 
 		 1212 aa  93.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  46.27 
 
 		 1053 aa  94  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  36.13 
 
 		 833 aa  90.9  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.74 
 
 		 1292 aa  88.2  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.49 
 
 		 848 aa  86.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  37.14 
 
 		 1107 aa  86.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.71 
 
 		 1283 aa  87  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.72 
 
 		 1043 aa  86.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 863 aa  85.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.87 
 
 		 1286 aa  85.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  31.22 
 
 		 868 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  31.42 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.67 
 
 		 868 aa  79  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  31.67 
 
 		 868 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  28.46 
 
 		 1146 aa  76.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  41.59 
 
 		 1147 aa  76.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  41.09 
 
 		 1258 aa  75.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  33.71 
 
 		 869 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  29.96 
 
 		 994 aa  73.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  48.15 
 
 		 1220 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 868 aa  72  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  43.44 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 867 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  42.62 
 
 		 567 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.83 
 
 		 848 aa  70.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.12 
 
 		 1323 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  32.75 
 
 		 868 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 868 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.93 
 
 		 1217 aa  68.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.86 
 
 		 972 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  30.92 
 
 		 1265 aa  66.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1750 aa  65.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.39 
 
 		 1399 aa  65.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  39.34 
 
 		 1042 aa  64.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.26 
 
 		 911 aa  64.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  44.57 
 
 		 1215 aa  64.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.92 
 
 		 913 aa  63.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  29.69 
 
 		 1321 aa  64.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  39.13 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.05 
 
 		 1212 aa  62.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.15 
 
 		 1212 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  26.26 
 
 		 985 aa  61.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3303  chitinase domain-containing protein  29.05 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  31.25 
 
 		 1168 aa  60.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.15 
 
 		 1212 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  23.35 
 
 		 1287 aa  58.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  44.71 
 
 		 528 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  33.12 
 
 		 571 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1624  hypothetical protein  29.86 
 
 		 634 aa  57.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  27.14 
 
 		 989 aa  57  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 		 1212 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1315 aa  56.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.7 
 
 		 773 aa  55.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1011 aa  55.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.89 
 
 		 728 aa  55.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  35.56 
 
 		 702 aa  55.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  38.79 
 
 		 568 aa  55.1  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  33.68 
 
 		 1011 aa  55.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  38.54 
 
 		 450 aa  55.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  27.19 
 
 		 765 aa  55.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  29.24 
 
 		 514 aa  55.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  39.66 
 
 		 1725 aa  54.3  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1022 aa  54.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 		 860 aa  53.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 		 973 aa  52.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.24 
 
 		 1776 aa  52.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  32.07 
 
 		 591 aa  52.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.27 
 
 		 1215 aa  52  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.27 
 
 		 1215 aa  52  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  35.94 
 
 		 820 aa  52  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  35.29 
 
 		 732 aa  51.6  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3193  putative lipoprotein  30.07 
 
 		 647 aa  51.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.52328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  32.79 
 
 		 1631 aa  51.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.15 
 
 		 927 aa  51.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  39.36 
 
 		 460 aa  51.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 891 aa  51.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  30.77 
 
 		 1962 aa  50.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1884 aa  50.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.79 
 
 		 600 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  34.48 
 
 		 809 aa  50.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  30.43 
 
 		 560 aa  49.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  33.66 
 
 		 513 aa  49.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  34.62 
 
 		 1035 aa  48.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  32.2 
 
 		 587 aa  48.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>