More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3374 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.47 
 
 		 1705 aa  766    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  34.01 
 
 		 1634 aa  825    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.78 
 
 		 1645 aa  884    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.19 
 
 		 1649 aa  693    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.89 
 
 		 1474 aa  705    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.69 
 
 		 1648 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.28 
 
 		 1649 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  33.7 
 
 		 1705 aa  781    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 1638 aa  3374    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  97.99 
 
 		 1638 aa  3266    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  33.8 
 
 		 1705 aa  782    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.75 
 
 		 1648 aa  898    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.09 
 
 		 1648 aa  890    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.42 
 
 		 1659 aa  833    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.96 
 
 		 1669 aa  752    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.43 
 
 		 1706 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  80.29 
 
 		 1639 aa  2738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  56.8 
 
 		 1638 aa  1900    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  34.24 
 
 		 1683 aa  776    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  34.82 
 
 		 1725 aa  843    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  35.65 
 
 		 1739 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  39.56 
 
 		 1265 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  39.57 
 
 		 1258 aa  530  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.93 
 
 		 1312 aa  524  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  34.34 
 
 		 1287 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.02 
 
 		 1199 aa  492  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  33.33 
 
 		 1298 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  33.33 
 
 		 1298 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  35.96 
 
 		 1300 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.13 
 
 		 1293 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  33.3 
 
 		 1298 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  33.07 
 
 		 1298 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  31.62 
 
 		 1300 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.8 
 
 		 1399 aa  435  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1406 aa  386  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1109 aa  363  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.77 
 
 		 1312 aa  256  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  31.79 
 
 		 1042 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1099 aa  248  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 		 1099 aa  243  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  28.85 
 
 		 994 aa  231  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  28.27 
 
 		 971 aa  231  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  31.72 
 
 		 1116 aa  231  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  30.91 
 
 		 1115 aa  229  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 		 1000 aa  226  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  28.65 
 
 		 1006 aa  201  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  27.21 
 
 		 1109 aa  196  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  29.01 
 
 		 1045 aa  191  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  27.88 
 
 		 983 aa  191  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.3 
 
 		 1283 aa  184  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.26 
 
 		 1292 aa  173  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  26.86 
 
 		 1321 aa  172  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.6 
 
 		 1286 aa  162  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  27.76 
 
 		 1407 aa  154  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  27.76 
 
 		 1407 aa  154  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1407 aa  152  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0984  hypothetical protein  34.97 
 
 		 319 aa  152  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.29 
 
 		 1160 aa  149  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.56 
 
 		 728 aa  147  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  26.62 
 
 		 1406 aa  147  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 		 915 aa  130  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.29 
 
 		 917 aa  129  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.42 
 
 		 917 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  26.02 
 
 		 917 aa  127  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  25.8 
 
 		 917 aa  126  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  25.86 
 
 		 917 aa  126  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  25.86 
 
 		 917 aa  126  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  25.99 
 
 		 917 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.99 
 
 		 917 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.66 
 
 		 891 aa  123  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  25.13 
 
 		 917 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.19 
 
 		 1565 aa  122  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  31.46 
 
 		 962 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.76 
 
 		 1124 aa  111  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  25.09 
 
 		 1570 aa  110  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  27.39 
 
 		 1035 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.35 
 
 		 660 aa  104  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  25.54 
 
 		 1962 aa  102  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.43 
 
 		 1570 aa  100  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.2 
 
 		 1212 aa  99.8  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  24.84 
 
 		 1809 aa  98.6  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  26.27 
 
 		 1215 aa  97.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  24.25 
 
 		 1220 aa  96.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.63 
 
 		 860 aa  90.5  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.11 
 
 		 1323 aa  89.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.38 
 
 		 1618 aa  87.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  39.56 
 
 		 1324 aa  81.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  43.75 
 
 		 1333 aa  80.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  24.2 
 
 		 1570 aa  78.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  25.43 
 
 		 1233 aa  77  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 		 1776 aa  77  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.58 
 
 		 1060 aa  75.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.77 
 
 		 1212 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  31.1 
 
 		 235 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.61 
 
 		 1212 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.46 
 
 		 1253 aa  72.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  47.19 
 
 		 1239 aa  71.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.32 
 
 		 1106 aa  71.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.13 
 
 		 1092 aa  70.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  26.13 
 
 		 1221 aa  70.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>