259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2960 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4539  serine protease  47.15 
 
 		 1634 aa  1445    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.62 
 
 		 1474 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.18 
 
 		 1648 aa  877    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  36.88 
 
 		 1705 aa  972    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.46 
 
 		 1638 aa  821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.37 
 
 		 1638 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  37.04 
 
 		 1705 aa  972    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.18 
 
 		 1648 aa  893    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.55 
 
 		 1648 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.86 
 
 		 1669 aa  935    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.15 
 
 		 1706 aa  930    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1639 aa  836    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  35.02 
 
 		 1638 aa  808    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  37.1 
 
 		 1683 aa  942    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  37.66 
 
 		 1725 aa  897    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  37.36 
 
 		 1739 aa  983    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  75.73 
 
 		 1649 aa  2623    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.94 
 
 		 1705 aa  982    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 1659 aa  3430    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.62 
 
 		 1645 aa  882    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.1 
 
 		 1649 aa  914    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  36.57 
 
 		 1265 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.02 
 
 		 1199 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  41.42 
 
 		 1258 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  38.47 
 
 		 1298 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  38.41 
 
 		 1298 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  38.15 
 
 		 1300 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  38.41 
 
 		 1298 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  36.59 
 
 		 1300 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  36.37 
 
 		 1287 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.39 
 
 		 1312 aa  516  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  38.01 
 
 		 1298 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.9 
 
 		 1293 aa  500  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.67 
 
 		 1399 aa  426  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1109 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1406 aa  354  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.37 
 
 		 1099 aa  322  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1099 aa  311  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  36.14 
 
 		 1312 aa  286  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  33.81 
 
 		 1115 aa  272  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  32.29 
 
 		 1116 aa  265  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  30.37 
 
 		 983 aa  254  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  32.77 
 
 		 1042 aa  252  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 		 1000 aa  250  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  29.47 
 
 		 971 aa  241  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  31.16 
 
 		 1006 aa  240  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.59 
 
 		 1283 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  29.6 
 
 		 1045 aa  223  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 		 1286 aa  221  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  29.2 
 
 		 1109 aa  211  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  28.81 
 
 		 994 aa  199  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.74 
 
 		 1292 aa  196  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0984  hypothetical protein  39.48 
 
 		 319 aa  179  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  28.25 
 
 		 1321 aa  175  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.19 
 
 		 1160 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.58 
 
 		 891 aa  144  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  29.72 
 
 		 1035 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  24 
 
 		 917 aa  128  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  23.87 
 
 		 917 aa  126  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  23.29 
 
 		 917 aa  126  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  26.15 
 
 		 1406 aa  126  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  23.61 
 
 		 917 aa  125  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  23.9 
 
 		 917 aa  126  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  23.9 
 
 		 917 aa  126  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  25.68 
 
 		 1407 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  23.48 
 
 		 917 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  25.68 
 
 		 1407 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1407 aa  121  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.65 
 
 		 915 aa  121  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.23 
 
 		 728 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  23.61 
 
 		 917 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.34 
 
 		 1776 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  23.74 
 
 		 917 aa  116  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  27.07 
 
 		 962 aa  115  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.07 
 
 		 860 aa  110  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 		 1565 aa  108  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  25.52 
 
 		 1962 aa  103  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  25.84 
 
 		 1809 aa  101  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.81 
 
 		 1570 aa  99.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.86 
 
 		 1618 aa  99  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.44 
 
 		 1124 aa  98.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.2 
 
 		 1323 aa  96.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.48 
 
 		 860 aa  89.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.24 
 
 		 1215 aa  88.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  45.31 
 
 		 1239 aa  87  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.18 
 
 		 1253 aa  86.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.03 
 
 		 1570 aa  85.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 660 aa  84.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.74 
 
 		 1220 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.03 
 
 		 1570 aa  84  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.92 
 
 		 1106 aa  83.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.53 
 
 		 1212 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  43.85 
 
 		 1324 aa  82  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  29.59 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  23.03 
 
 		 2042 aa  79.3  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  48.45 
 
 		 1333 aa  78.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.38 
 
 		 1191 aa  77.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.91 
 
 		 1060 aa  76.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  32.38 
 
 		 1221 aa  76.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.54 
 
 		 883 aa  76.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>