22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0984 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0984  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  67.91 
 
 		 1705 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  67.91 
 
 		 1705 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  64.24 
 
 		 1705 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  64.29 
 
 		 1669 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  64.26 
 
 		 1706 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  60.88 
 
 		 1683 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  43.07 
 
 		 1739 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.49 
 
 		 1649 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.65 
 
 		 1648 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.91 
 
 		 1648 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  39 
 
 		 1634 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.76 
 
 		 1648 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.89 
 
 		 1649 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.91 
 
 		 1659 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  37.82 
 
 		 1725 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.36 
 
 		 1645 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  33.95 
 
 		 1638 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1639 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.46 
 
 		 1638 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.46 
 
 		 1638 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 		 1474 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>