261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0635 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2696  serine protease  41.2 
 
 
1739 aa  1140    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  35.78 
 
 
1634 aa  881    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.39 
 
 
1649 aa  947    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.26 
 
 
1649 aa  924    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.66 
 
 
1645 aa  853    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  77.26 
 
 
1705 aa  2722    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.57 
 
 
1474 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.39 
 
 
1648 aa  849    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  73.42 
 
 
1705 aa  2581    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.12 
 
 
1638 aa  760    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.01 
 
 
1638 aa  764    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  73.42 
 
 
1705 aa  2582    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.49 
 
 
1648 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.07 
 
 
1659 aa  924    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.37 
 
 
1648 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.69 
 
 
1669 aa  2114    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  66.86 
 
 
1706 aa  2300    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  34.75 
 
 
1639 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  34.33 
 
 
1638 aa  818    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  100 
 
 
1683 aa  3470    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  36.11 
 
 
1725 aa  889    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  39.69 
 
 
1265 aa  552  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  40.47 
 
 
1258 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  38.97 
 
 
1298 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  34.55 
 
 
1298 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  35.66 
 
 
1300 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  38.23 
 
 
1298 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  38.3 
 
 
1298 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  34.44 
 
 
1287 aa  489  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.63 
 
 
1293 aa  486  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  33.55 
 
 
1300 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.59 
 
 
1312 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 
1199 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.87 
 
 
1399 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0984  hypothetical protein  58.99 
 
 
319 aa  387  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  33.03 
 
 
1109 aa  355  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  29.86 
 
 
1406 aa  341  7e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.79 
 
 
1099 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  29.71 
 
 
1099 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.91 
 
 
1312 aa  220  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  33.23 
 
 
1115 aa  219  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  29.99 
 
 
1116 aa  215  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  32.28 
 
 
983 aa  200  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  29.82 
 
 
1006 aa  184  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  29.42 
 
 
971 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  29.73 
 
 
1042 aa  178  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
1000 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  27.63 
 
 
994 aa  167  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  28.66 
 
 
1109 aa  164  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.48 
 
 
1283 aa  162  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.92 
 
 
1292 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  30.27 
 
 
1045 aa  155  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
1286 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  26.3 
 
 
1406 aa  127  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  26.61 
 
 
1407 aa  126  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  26.61 
 
 
1407 aa  126  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  28.03 
 
 
1035 aa  122  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  25.62 
 
 
1407 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.12 
 
 
1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.2 
 
 
962 aa  116  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  22.91 
 
 
917 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 
891 aa  112  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  24.28 
 
 
917 aa  112  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  24.14 
 
 
917 aa  112  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.02 
 
 
915 aa  112  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  23.78 
 
 
917 aa  108  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.36 
 
 
1618 aa  107  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  23.49 
 
 
917 aa  106  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 
1323 aa  106  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
660 aa  105  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  24.32 
 
 
1962 aa  105  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.86 
 
 
1570 aa  103  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.38 
 
 
1776 aa  102  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.58 
 
 
1570 aa  95.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.46 
 
 
1570 aa  94  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  31.23 
 
 
1321 aa  92.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.76 
 
 
860 aa  92  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.77 
 
 
728 aa  91.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.15 
 
 
1212 aa  92  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.28 
 
 
1809 aa  87.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.32 
 
 
860 aa  86.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.48 
 
 
1124 aa  86.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.28 
 
 
1060 aa  83.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.57 
 
 
1075 aa  83.2  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  23.75 
 
 
1215 aa  78.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  43.9 
 
 
1239 aa  77.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  35.62 
 
 
917 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  25.81 
 
 
1220 aa  77  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  35 
 
 
917 aa  75.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  35 
 
 
917 aa  75.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  35 
 
 
917 aa  75.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  23.14 
 
 
2042 aa  73.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  38.71 
 
 
1285 aa  71.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.59 
 
 
1234 aa  70.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  35.67 
 
 
1315 aa  70.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.86 
 
 
1253 aa  69.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.88 
 
 
1106 aa  69.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 
1212 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 
1212 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.89 
 
 
1212 aa  69.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>