223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1513 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1099 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.57 
 
 		 1099 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  90.65 
 
 		 1115 aa  1995    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  100 
 
 		 1116 aa  2251    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1109 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  36.24 
 
 		 983 aa  352  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1406 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  39.03 
 
 		 1312 aa  335  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.18 
 
 		 1474 aa  328  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  35.76 
 
 		 1258 aa  327  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  34.66 
 
 		 1265 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  32.86 
 
 		 1042 aa  318  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.08 
 
 		 1000 aa  304  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.4 
 
 		 1645 aa  299  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.75 
 
 		 1648 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.75 
 
 		 1648 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  35.74 
 
 		 1725 aa  297  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  37.89 
 
 		 1006 aa  295  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.75 
 
 		 1648 aa  295  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.15 
 
 		 1283 aa  290  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  35.35 
 
 		 1109 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  35.29 
 
 		 994 aa  285  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  36.54 
 
 		 1045 aa  284  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  33.33 
 
 		 1287 aa  282  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.76 
 
 		 1199 aa  283  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  35.13 
 
 		 1634 aa  279  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  35.78 
 
 		 971 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.34 
 
 		 1312 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  33.48 
 
 		 1300 aa  269  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.05 
 
 		 1659 aa  269  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  32.38 
 
 		 1298 aa  267  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  33.83 
 
 		 1300 aa  267  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  32.45 
 
 		 1298 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  32.38 
 
 		 1298 aa  264  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  32.05 
 
 		 1298 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  33.43 
 
 		 1739 aa  258  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.43 
 
 		 1293 aa  257  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.57 
 
 		 1649 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 1286 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.85 
 
 		 1669 aa  251  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.55 
 
 		 1292 aa  251  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.09 
 
 		 1706 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  30.65 
 
 		 1705 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  30.65 
 
 		 1705 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  32.42 
 
 		 1638 aa  241  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.13 
 
 		 1705 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1639 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.36 
 
 		 1638 aa  237  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.47 
 
 		 1638 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 		 1399 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.5 
 
 		 1649 aa  233  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  29.86 
 
 		 1683 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  26.7 
 
 		 1321 aa  221  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.77 
 
 		 1160 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  29.88 
 
 		 1035 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  24.77 
 
 		 917 aa  154  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  25.33 
 
 		 917 aa  153  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  25.07 
 
 		 917 aa  151  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  24.93 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  24.93 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  24.3 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  25.07 
 
 		 917 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  24.8 
 
 		 917 aa  149  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  25.8 
 
 		 917 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1407 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  24.79 
 
 		 1406 aa  141  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1407 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.08 
 
 		 915 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  26.01 
 
 		 1407 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.99 
 
 		 962 aa  125  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 		 860 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.43 
 
 		 1124 aa  116  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 		 891 aa  115  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.52 
 
 		 1776 aa  108  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  28.47 
 
 		 1618 aa  107  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.17 
 
 		 1570 aa  105  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.55 
 
 		 1570 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.36 
 
 		 660 aa  101  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  26 
 
 		 1221 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  24.76 
 
 		 1220 aa  94.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.45 
 
 		 1570 aa  94.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.73 
 
 		 1092 aa  92.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  25.71 
 
 		 1809 aa  91.3  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  33.33 
 
 		 1333 aa  89  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  24.38 
 
 		 1215 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.3 
 
 		 1060 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.08 
 
 		 1323 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 		 1234 aa  84.7  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.78 
 
 		 860 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  23.67 
 
 		 1962 aa  83.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.3 
 
 		 1212 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  23.24 
 
 		 2042 aa  81.3  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  40 
 
 		 1239 aa  79.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.06 
 
 		 883 aa  77.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  34.58 
 
 		 1285 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.18 
 
 		 1212 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.18 
 
 		 1212 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.18 
 
 		 1212 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.35 
 
 		 1078 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>