234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0555 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1399 aa  2878    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 
1199 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  33.22 
 
 
1265 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  33.26 
 
 
1258 aa  572  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.73 
 
 
1474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.77 
 
 
1312 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  29.38 
 
 
1287 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 
1293 aa  466  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  28.77 
 
 
1300 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  29.13 
 
 
1298 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  29.09 
 
 
1298 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  29.3 
 
 
1298 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  29.09 
 
 
1298 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  28.75 
 
 
1300 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  30.87 
 
 
1683 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  30.74 
 
 
1634 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  31.15 
 
 
1705 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  31.15 
 
 
1705 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  31.4 
 
 
1739 aa  445  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 
1705 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.8 
 
 
1638 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.48 
 
 
1638 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.33 
 
 
1645 aa  432  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 
1669 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  30.29 
 
 
1639 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.61 
 
 
1659 aa  426  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.02 
 
 
1649 aa  423  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  29.5 
 
 
1638 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.01 
 
 
1706 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.52 
 
 
1649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
1648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
1648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.59 
 
 
1648 aa  406  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  29.41 
 
 
1725 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  33.67 
 
 
1109 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  28.61 
 
 
1406 aa  347  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  29.23 
 
 
983 aa  281  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 
1099 aa  265  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  30.1 
 
 
1099 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.59 
 
 
1312 aa  245  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  30.21 
 
 
994 aa  241  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
1000 aa  235  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  32.2 
 
 
971 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  31.3 
 
 
1116 aa  226  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  30.47 
 
 
1115 aa  222  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  29.22 
 
 
1006 aa  219  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  28 
 
 
1042 aa  206  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
1109 aa  197  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 
1292 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.55 
 
 
1283 aa  161  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  24.78 
 
 
1045 aa  156  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  31.7 
 
 
1407 aa  141  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.4 
 
 
1286 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  31.7 
 
 
1407 aa  141  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  31.4 
 
 
1407 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  30.14 
 
 
1406 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  26.77 
 
 
917 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.7 
 
 
917 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.12 
 
 
917 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  26 
 
 
917 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  26 
 
 
917 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  25.78 
 
 
917 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  26.51 
 
 
917 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 
1323 aa  122  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  26.52 
 
 
917 aa  122  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.75 
 
 
915 aa  121  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  25.78 
 
 
917 aa  116  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  26.81 
 
 
1035 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.03 
 
 
1160 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.46 
 
 
660 aa  104  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  27.52 
 
 
1962 aa  102  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 
1092 aa  102  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  28.48 
 
 
1321 aa  98.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
728 aa  94.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 
1234 aa  94.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  27.11 
 
 
962 aa  94  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.99 
 
 
1565 aa  94  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  25.1 
 
 
1233 aa  93.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
891 aa  91.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.77 
 
 
1776 aa  90.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
1124 aa  89.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  24.74 
 
 
1570 aa  87.8  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  26.99 
 
 
1215 aa  87  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  26.83 
 
 
1221 aa  85.5  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  24.34 
 
 
1618 aa  84.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  24.54 
 
 
2042 aa  80.1  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.08 
 
 
1383 aa  80.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.51 
 
 
883 aa  78.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.88 
 
 
860 aa  77.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.63 
 
 
1212 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.63 
 
 
1212 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 
1212 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  41.35 
 
 
1324 aa  75.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 
1060 aa  75.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  25.77 
 
 
1220 aa  75.1  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  35.82 
 
 
1393 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.64 
 
 
412 aa  70.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  42.57 
 
 
1333 aa  69.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0754  alkaline serine protease  29.41 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.97 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>