207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1394 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 1109 aa  2248    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.59 
 
 		 1474 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  39.7 
 
 		 1265 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  40.29 
 
 		 1258 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.82 
 
 		 1312 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1099 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.73 
 
 		 1099 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.95 
 
 		 1199 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.39 
 
 		 1645 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  36.68 
 
 		 1406 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  35.52 
 
 		 1300 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.41 
 
 		 1292 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.09 
 
 		 1649 aa  416  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.19 
 
 		 1293 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  35.3 
 
 		 1298 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.59 
 
 		 1283 aa  413  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  35.3 
 
 		 1298 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  33.13 
 
 		 1116 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  35.3 
 
 		 1298 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  35.16 
 
 		 1287 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  34.63 
 
 		 1300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  35.05 
 
 		 1298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  32.95 
 
 		 1115 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.12 
 
 		 1659 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  35.14 
 
 		 1725 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  34.69 
 
 		 1634 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.13 
 
 		 1649 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.05 
 
 		 1648 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.01 
 
 		 1286 aa  386  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.89 
 
 		 1648 aa  386  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.89 
 
 		 1648 aa  386  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1639 aa  386  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.06 
 
 		 1399 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.11 
 
 		 1705 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.04 
 
 		 1638 aa  363  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  34.83 
 
 		 1705 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  34.83 
 
 		 1705 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.63 
 
 		 1638 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  35.03 
 
 		 1739 aa  358  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  33.03 
 
 		 1683 aa  355  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  31.09 
 
 		 1321 aa  352  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  33.66 
 
 		 1638 aa  351  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.24 
 
 		 1669 aa  343  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.47 
 
 		 1706 aa  336  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  35.9 
 
 		 1312 aa  325  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.83 
 
 		 1035 aa  318  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  33.73 
 
 		 983 aa  304  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  31.95 
 
 		 1042 aa  297  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  32.29 
 
 		 1109 aa  279  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  33.92 
 
 		 1006 aa  276  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  32.13 
 
 		 1045 aa  262  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.09 
 
 		 1000 aa  261  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  30.96 
 
 		 994 aa  254  7e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  31.79 
 
 		 971 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.23 
 
 		 1160 aa  192  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.61 
 
 		 728 aa  184  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  28.32 
 
 		 1407 aa  157  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  28.32 
 
 		 1407 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1407 aa  157  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  27.71 
 
 		 1406 aa  154  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  24.04 
 
 		 917 aa  128  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  23.07 
 
 		 917 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  23.07 
 
 		 917 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  24.5 
 
 		 917 aa  127  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  23.07 
 
 		 917 aa  126  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  24.04 
 
 		 917 aa  125  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.31 
 
 		 915 aa  125  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  23.3 
 
 		 917 aa  124  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  23.54 
 
 		 917 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  22.95 
 
 		 917 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.83 
 
 		 962 aa  122  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  25.51 
 
 		 1220 aa  119  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.55 
 
 		 1565 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.08 
 
 		 1212 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 		 891 aa  114  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.75 
 
 		 1323 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.11 
 
 		 1212 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  24.16 
 
 		 1215 aa  108  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.11 
 
 		 1212 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.68 
 
 		 1212 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 		 860 aa  106  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.85 
 
 		 1060 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 		 1092 aa  98.2  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.75 
 
 		 1124 aa  97.8  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.46 
 
 		 1570 aa  97.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 		 860 aa  97.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 		 1383 aa  95.9  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.35 
 
 		 1776 aa  95.9  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  34.62 
 
 		 235 aa  95.5  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.47 
 
 		 1618 aa  95.1  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  25.47 
 
 		 1962 aa  94.7  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.08 
 
 		 1234 aa  90.9  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.17 
 
 		 660 aa  89.4  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.54 
 
 		 1570 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  39.24 
 
 		 1324 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  32.64 
 
 		 1333 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.25 
 
 		 1110 aa  80.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.79 
 
 		 1570 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.23 
 
 		 1078 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 		 1253 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.338305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>