174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4515 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  30.3 
 
 
1695 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  100 
 
 
5743 aa  11500    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  23.9 
 
 
1951 aa  204  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  29.48 
 
 
2528 aa  198  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  25.53 
 
 
2552 aa  127  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.04 
 
 
3586 aa  110  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  30.53 
 
 
1570 aa  107  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.07 
 
 
1428 aa  106  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  26.03 
 
 
1096 aa  105  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.93 
 
 
1219 aa  104  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.97 
 
 
6885 aa  101  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.41 
 
 
1332 aa  98.2  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  26.91 
 
 
1462 aa  98.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  29.01 
 
 
1424 aa  95.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.44 
 
 
1570 aa  89  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.98 
 
 
1919 aa  89.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  26.98 
 
 
482 aa  88.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.13 
 
 
5559 aa  88.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  23.37 
 
 
5561 aa  87.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.13 
 
 
5559 aa  87.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  23.24 
 
 
1795 aa  87  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.06 
 
 
5561 aa  85.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.13 
 
 
3325 aa  84  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 
1047 aa  83.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  23.38 
 
 
926 aa  83.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.44 
 
 
820 aa  82  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  26.78 
 
 
805 aa  80.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  25.36 
 
 
1608 aa  79.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 
1628 aa  78.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.44 
 
 
5561 aa  78.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  26.1 
 
 
892 aa  78.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.8 
 
 
1143 aa  77.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.48 
 
 
4106 aa  77.4  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.53 
 
 
831 aa  77  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.11 
 
 
1152 aa  74.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  24.68 
 
 
653 aa  73.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  25.46 
 
 
675 aa  73.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.05 
 
 
898 aa  73.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  25.61 
 
 
3562 aa  73.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  28.69 
 
 
2002 aa  73.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  25.38 
 
 
3824 aa  73.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  25.21 
 
 
3739 aa  72.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  27.01 
 
 
1657 aa  72.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.9 
 
 
680 aa  72.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  25.55 
 
 
3721 aa  72.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.9 
 
 
899 aa  70.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  25.21 
 
 
3824 aa  70.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  33.16 
 
 
513 aa  70.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  25.33 
 
 
744 aa  70.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  25.8 
 
 
3824 aa  70.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.96 
 
 
5216 aa  69.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 
1505 aa  69.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.27 
 
 
4874 aa  69.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 
3552 aa  68.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.87 
 
 
3027 aa  67.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.93 
 
 
1448 aa  67.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.51 
 
 
3734 aa  67.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  25.43 
 
 
1902 aa  67.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  28.01 
 
 
1457 aa  67.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  31.16 
 
 
782 aa  66.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  25.55 
 
 
3925 aa  67  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  25.46 
 
 
3736 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  27.85 
 
 
1199 aa  65.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.17 
 
 
3802 aa  65.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  27.52 
 
 
499 aa  64.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  27.27 
 
 
711 aa  64.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  27.57 
 
 
1285 aa  64.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  25.81 
 
 
631 aa  63.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.46 
 
 
803 aa  62.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  26.13 
 
 
2704 aa  61.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.9 
 
 
4689 aa  60.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.99 
 
 
692 aa  60.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  29.58 
 
 
1222 aa  60.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  27.79 
 
 
1825 aa  60.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  28.1 
 
 
1224 aa  59.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  39.78 
 
 
1307 aa  59.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.05 
 
 
587 aa  59.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  26.79 
 
 
455 aa  58.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
1121 aa  58.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  25.29 
 
 
2474 aa  58.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  29.81 
 
 
531 aa  58.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  26.32 
 
 
455 aa  57.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 
587 aa  57.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  26.32 
 
 
455 aa  57.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.42 
 
 
2350 aa  57.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  20.8 
 
 
2402 aa  57.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  35.14 
 
 
224 aa  57.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 
6109 aa  56.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  28.4 
 
 
1847 aa  57  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  24.26 
 
 
2927 aa  56.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  26.75 
 
 
456 aa  55.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  25.44 
 
 
455 aa  56.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.33 
 
 
3314 aa  55.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1341  hypothetical protein  38.1 
 
 
967 aa  55.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.274019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  34.23 
 
 
224 aa  55.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  26.78 
 
 
1146 aa  55.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.67 
 
 
2334 aa  54.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  27.23 
 
 
804 aa  54.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  26.23 
 
 
1141 aa  54.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.27 
 
 
1452 aa  54.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>