105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1160 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 1657 aa  3256    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.71 
 
 		 692 aa  312  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1825 aa  244  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  31.19 
 
 		 1951 aa  221  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  53.05 
 
 		 793 aa  181  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.31 
 
 		 1919 aa  176  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  37.11 
 
 		 2117 aa  145  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  31.71 
 
 		 635 aa  112  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1026 aa  110  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  39.06 
 
 		 373 aa  110  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  54.21 
 
 		 1222 aa  105  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  32.97 
 
 		 637 aa  101  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  44.25 
 
 		 652 aa  100  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  37.31 
 
 		 312 aa  96.3  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  43.59 
 
 		 1201 aa  95.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  28.07 
 
 		 1795 aa  93.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.68 
 
 		 2802 aa  91.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  36.08 
 
 		 604 aa  90.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.83 
 
 		 2552 aa  86.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.59 
 
 		 5743 aa  84.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  34.78 
 
 		 878 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  34.78 
 
 		 878 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  28.48 
 
 		 913 aa  80.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  25.77 
 
 		 653 aa  81.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  41.8 
 
 		 383 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.09 
 
 		 3227 aa  79  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3358  hypothetical protein  34.46 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0199152 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.33 
 
 		 1332 aa  78.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  39.52 
 
 		 551 aa  78.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.64 
 
 		 1141 aa  77.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  30.69 
 
 		 675 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  44.25 
 
 		 715 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  33.67 
 
 		 599 aa  77.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  32.65 
 
 		 514 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  31.33 
 
 		 975 aa  74.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.29 
 
 		 3734 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.6 
 
 		 1505 aa  73.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.71 
 
 		 3586 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.75 
 
 		 1219 aa  71.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1792 aa  69.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  31.41 
 
 		 878 aa  67.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  31.33 
 
 		 979 aa  63.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1114  3D domain protein  32.54 
 
 		 1063 aa  64.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  32.09 
 
 		 1047 aa  62  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.99 
 
 		 1096 aa  61.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  31.63 
 
 		 3325 aa  61.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1439 aa  59.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  27.11 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.01 
 
 		 805 aa  58.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  34.07 
 
 		 1496 aa  56.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  28.65 
 
 		 1424 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.85 
 
 		 639 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.08 
 
 		 3736 aa  54.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.32 
 
 		 499 aa  54.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.93 
 
 		 322 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  37.11 
 
 		 264 aa  54.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.32 
 
 		 940 aa  54.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  27.11 
 
 		 916 aa  53.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1902 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.86 
 
 		 1428 aa  53.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  27.72 
 
 		 2704 aa  53.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.12 
 
 		 5561 aa  53.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  37.63 
 
 		 759 aa  53.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.77 
 
 		 1143 aa  53.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  29.53 
 
 		 714 aa  53.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.52 
 
 		 1224 aa  52.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.77 
 
 		 2402 aa  52  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  34.68 
 
 		 482 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2184  hypothetical protein  26.69 
 
 		 713 aa  51.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  43.9 
 
 		 1937 aa  51.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.86 
 
 		 2625 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 		 587 aa  50.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  30.11 
 
 		 744 aa  50.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.94 
 
 		 602 aa  50.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.3 
 
 		 3925 aa  49.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  27.55 
 
 		 892 aa  49.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 2886 aa  48.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  35.74 
 
 		 777 aa  48.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  46.3 
 
 		 690 aa  48.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  31.22 
 
 		 606 aa  48.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 		 587 aa  48.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  33.71 
 
 		 848 aa  48.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  30.41 
 
 		 549 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1756 aa  47.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  44 
 
 		 1467 aa  47.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.69 
 
 		 3552 aa  47.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1879 aa  47.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  31.07 
 
 		 736 aa  47.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  22.74 
 
 		 346 aa  47  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  30.43 
 
 		 758 aa  47.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.07 
 
 		 820 aa  47.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1634 aa  47.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  37.72 
 
 		 1197 aa  47  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  30.03 
 
 		 739 aa  47  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  30.69 
 
 		 343 aa  46.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.11 
 
 		 1152 aa  46.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  27.44 
 
 		 2456 aa  46.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  28.35 
 
 		 2350 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.62 
 
 		 913 aa  46.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.9 
 
 		 5216 aa  46.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>