46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2060 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  617  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  45.65 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  35.49 
 
 		 975 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  38.43 
 
 		 495 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1201 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.88 
 
 		 694 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 814 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1657 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  39.44 
 
 		 1951 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.07 
 
 		 3227 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.35 
 
 		 1919 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1405 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1825 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.83 
 
 		 2117 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  29.41 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1413 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.76 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  31 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  31 
 
 		 932 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1597 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  29.7 
 
 		 633 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0647  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.91 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1114  3D domain protein  37.5 
 
 		 1063 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  29.49 
 
 		 723 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  34.38 
 
 		 755 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  33.65 
 
 		 1049 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.67 
 
 		 1332 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4660  hypothetical protein  31.25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  32.82 
 
 		 714 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  33 
 
 		 649 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  28.57 
 
 		 913 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1439 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  33.33 
 
 		 669 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  27.96 
 
 		 513 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  28.46 
 
 		 1013 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  39.84 
 
 		 777 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 1505 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1121 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.46 
 
 		 517 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  32.96 
 
 		 911 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  37.93 
 
 		 455 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  37.93 
 
 		 455 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  35.19 
 
 		 1141 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  31.97 
 
 		 1011 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  30 
 
 		 1146 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>