146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2130 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  100 
 
 		 932 aa  1904    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  96.4 
 
 		 750 aa  1492    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  46.9 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  45.21 
 
 		 704 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  44.02 
 
 		 690 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.6 
 
 		 688 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.56 
 
 		 687 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.28 
 
 		 698 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.94 
 
 		 704 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  42.72 
 
 		 606 aa  396  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.96 
 
 		 709 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  37.72 
 
 		 638 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  40.26 
 
 		 470 aa  354  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.34 
 
 		 487 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  35.28 
 
 		 581 aa  321  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  39.77 
 
 		 434 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  33.41 
 
 		 460 aa  273  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  33.18 
 
 		 460 aa  270  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  34.66 
 
 		 410 aa  270  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  32.37 
 
 		 436 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  32.88 
 
 		 436 aa  238  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.7 
 
 		 467 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  27.88 
 
 		 674 aa  117  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  27.93 
 
 		 435 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  29.38 
 
 		 435 aa  108  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  33.01 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 473 aa  104  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 581 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  27.76 
 
 		 445 aa  101  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  26.49 
 
 		 596 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  24.42 
 
 		 429 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  25.76 
 
 		 479 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 431 aa  95.9  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 441 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  28.42 
 
 		 447 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.43 
 
 		 340 aa  94.7  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  26.36 
 
 		 452 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  25.28 
 
 		 440 aa  92  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.18 
 
 		 474 aa  90.5  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 485 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  24.41 
 
 		 538 aa  89  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  24.22 
 
 		 471 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  35.76 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  32.65 
 
 		 711 aa  84.7  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  25.95 
 
 		 473 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  24.14 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  24.06 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  24.17 
 
 		 446 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.85 
 
 		 1967 aa  80.1  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.72 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  31.25 
 
 		 755 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  24.05 
 
 		 627 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  30.25 
 
 		 494 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.09 
 
 		 3168 aa  74.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 491 aa  72  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  26.51 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  39 
 
 		 669 aa  71.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.07 
 
 		 1031 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  33.13 
 
 		 723 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  22.35 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  22.48 
 
 		 505 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.03 
 
 		 3396 aa  67  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  35.45 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 1037 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  31.3 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.62 
 
 		 1800 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  28.81 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  28.64 
 
 		 502 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  25.8 
 
 		 446 aa  64.3  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  24.26 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.78 
 
 		 1535 aa  62.4  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.65 
 
 		 446 aa  62  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  32.17 
 
 		 463 aa  62  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  23.18 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  20.97 
 
 		 537 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.42 
 
 		 1512 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  21.93 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  30 
 
 		 814 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  21.95 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  34.07 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  22.07 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  44 
 
 		 1479 aa  58.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  31 
 
 		 312 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  39.51 
 
 		 8871 aa  57  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  23.34 
 
 		 515 aa  56.6  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  22.01 
 
 		 464 aa  57  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.36 
 
 		 615 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.87 
 
 		 1661 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.78 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.31 
 
 		 1225 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.78 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  25.14 
 
 		 372 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.51 
 
 		 1415 aa  55.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.28 
 
 		 1180 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  27.91 
 
 		 495 aa  54.7  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  35.14 
 
 		 1029 aa  54.7  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.14 
 
 		 1029 aa  54.7  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.36 
 
 		 1118 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>