70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4475 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  100 
 
 
1121 aa  2271    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.44 
 
 
789 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  26.97 
 
 
752 aa  115  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.01 
 
 
644 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  23.64 
 
 
832 aa  97.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  26 
 
 
648 aa  95.5  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  26.72 
 
 
839 aa  94.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  24.7 
 
 
838 aa  88.6  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  47.92 
 
 
1505 aa  87.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  22.98 
 
 
627 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.89 
 
 
801 aa  85.1  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  37.29 
 
 
1049 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  24.74 
 
 
689 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  28.72 
 
 
722 aa  77  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  31.54 
 
 
951 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  32.64 
 
 
965 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  25.88 
 
 
791 aa  72  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.16 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  31.55 
 
 
653 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  34.18 
 
 
1795 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  26.87 
 
 
708 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  35.16 
 
 
1011 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.99 
 
 
677 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  38.98 
 
 
2286 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  34.18 
 
 
1013 aa  62  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  35.65 
 
 
1100 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  25.41 
 
 
788 aa  60.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0540  hypothetical protein  37.14 
 
 
500 aa  55.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0525494  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  21.75 
 
 
721 aa  55.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  35.63 
 
 
513 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.39 
 
 
1392 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  34.04 
 
 
714 aa  52.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0527  hypothetical protein  29.46 
 
 
480 aa  52.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0252239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  34.74 
 
 
755 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  31.73 
 
 
2344 aa  52.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 
1641 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2936  hypothetical protein  23.89 
 
 
1022 aa  51.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.897534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  24.05 
 
 
1597 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  41.94 
 
 
633 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  30 
 
 
362 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  26.06 
 
 
1951 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  23.41 
 
 
580 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1016  hypothetical protein  30.52 
 
 
513 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  40.58 
 
 
711 aa  48.9  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  36.78 
 
 
501 aa  48.9  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30 
 
 
464 aa  48.5  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  28.23 
 
 
474 aa  48.9  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  24.01 
 
 
563 aa  48.9  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  28.24 
 
 
346 aa  48.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  31.38 
 
 
2528 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  41.9 
 
 
635 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.61 
 
 
964 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0647  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.27 
 
 
410 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  27.5 
 
 
502 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.55 
 
 
694 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  22.69 
 
 
1332 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  25.21 
 
 
476 aa  46.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  25.87 
 
 
513 aa  45.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  25.87 
 
 
513 aa  45.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 
1641 aa  45.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  27.36 
 
 
478 aa  45.8  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.21 
 
 
405 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  27.18 
 
 
472 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  34.67 
 
 
665 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.26 
 
 
410 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  29.74 
 
 
499 aa  45.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  34.29 
 
 
653 aa  45.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  29.7 
 
 
496 aa  45.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  40.95 
 
 
1026 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  25.15 
 
 
382 aa  44.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>