35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2672 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  979    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  38.18 
 
 
544 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  43.78 
 
 
373 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01997  putative signal peptide protein  40.08 
 
 
253 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  38.43 
 
 
312 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1036  hypothetical protein  40.6 
 
 
404 aa  133  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700049  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4013  putative signal peptide protein  39.41 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.101497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3899  conserved hypothetical signal peptide protein  39.41 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.631521 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07863  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
599 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.275685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1490  conserved hypothetical signal peptide protein  37.27 
 
 
290 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  35.83 
 
 
814 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0960  hypothetical protein  29.11 
 
 
235 aa  113  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000651892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  34.63 
 
 
975 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5517  hypothetical protein  34.17 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0766  hypothetical protein  36.17 
 
 
398 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1035  hypothetical protein  34.4 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232126  normal  0.693723 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10899  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0776002  normal  0.0638828 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  34.52 
 
 
1201 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  28.9 
 
 
665 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08368  spherulin 4-like cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14080)  31.34 
 
 
305 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113087  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08367  cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14085)  29.26 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0338529  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  36.59 
 
 
1413 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  32.41 
 
 
642 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  29.34 
 
 
1405 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02952  cell surface spherulin 4-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07900)  27.89 
 
 
259 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.27 
 
 
694 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  31.25 
 
 
641 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  31.07 
 
 
755 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  27.45 
 
 
932 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  30.51 
 
 
633 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  23.3 
 
 
372 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  29.49 
 
 
1597 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  26.47 
 
 
750 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  28.85 
 
 
669 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 
658 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>