16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1035 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1035  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232126  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5517  hypothetical protein  51.1 
 
 
411 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1036  hypothetical protein  49.4 
 
 
404 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700049  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0766  hypothetical protein  45.38 
 
 
398 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102721 
 
 
-
 
NC_003296  RS01997  putative signal peptide protein  36.71 
 
 
253 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3899  conserved hypothetical signal peptide protein  37.97 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4013  putative signal peptide protein  37.97 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.101497  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1490  conserved hypothetical signal peptide protein  36.89 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0960  hypothetical protein  37.04 
 
 
235 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000651892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  34.41 
 
 
544 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  34.8 
 
 
495 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08368  spherulin 4-like cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14080)  31.36 
 
 
305 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113087  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02952  cell surface spherulin 4-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07900)  28.1 
 
 
259 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07863  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 
599 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.275685 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08367  cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14085)  24.69 
 
 
260 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0338529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  31.33 
 
 
727 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>