16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01997 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01997  putative signal peptide protein  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3899  conserved hypothetical signal peptide protein  70.08 
 
 		 284 aa  327  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4013  putative signal peptide protein  70.08 
 
 		 284 aa  327  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.101497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1490  conserved hypothetical signal peptide protein  58.7 
 
 		 290 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  41.1 
 
 		 495 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5517  hypothetical protein  38.75 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0766  hypothetical protein  38.31 
 
 		 398 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1035  hypothetical protein  36.71 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232126  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1036  hypothetical protein  36.97 
 
 		 404 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700049  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0960  hypothetical protein  33.79 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000651892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  32.45 
 
 		 544 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07863  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 599 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.275685 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08367  cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14085)  29.02 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0338529  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08368  spherulin 4-like cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14080)  32.57 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113087  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02952  cell surface spherulin 4-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07900)  24.58 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10899  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0776002  normal  0.0638828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>