16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3899 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3899  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4013  putative signal peptide protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.101497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01997  putative signal peptide protein  69.2 
 
 		 253 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1490  conserved hypothetical signal peptide protein  56.32 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5517  hypothetical protein  40.8 
 
 		 411 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  39.41 
 
 		 495 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0766  hypothetical protein  37.65 
 
 		 398 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1035  hypothetical protein  37.97 
 
 		 394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232126  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0960  hypothetical protein  34.91 
 
 		 235 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000651892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1036  hypothetical protein  35.44 
 
 		 404 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700049  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  30.71 
 
 		 544 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07863  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.275685 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08367  cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14085)  27.75 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0338529  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08368  spherulin 4-like cell surface protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14080)  30.45 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113087  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02952  cell surface spherulin 4-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07900)  27.53 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10899  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0776002  normal  0.0638828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>