159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4691 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 544 aa  1081    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07863  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 599 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.275685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  37.5 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1035  hypothetical protein  34.85 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232126  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_003296  RS01997  putative signal peptide protein  33.47 
 
 		 253 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1490  conserved hypothetical signal peptide protein  34.16 
 
 		 290 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3899  conserved hypothetical signal peptide protein  31.13 
 
 		 284 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4013  putative signal peptide protein  31.13 
 
 		 284 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.101497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  47.62 
 
 		 1154 aa  94.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  45.19 
 
 		 743 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1036  hypothetical protein  32.02 
 
 		 404 aa  91.3  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700049  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  47.46 
 
 		 614 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  47.76 
 
 		 608 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10899  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 249 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0776002  normal  0.0638828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 		 655 aa  88.2  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  51 
 
 		 854 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  49.49 
 
 		 762 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  53 
 
 		 658 aa  87.4  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  54.35 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5517  hypothetical protein  30.53 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  49.52 
 
 		 900 aa  84.7  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  48.57 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  45.05 
 
 		 235 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0960  hypothetical protein  30.05 
 
 		 235 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000651892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50 
 
 		 809 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  54.37 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  51.02 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  52.33 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0766  hypothetical protein  32.28 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  46.24 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  45.19 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  49.45 
 
 		 2286 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  47.87 
 
 		 1887 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  44.55 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  42.39 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  43.65 
 
 		 1200 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  48.6 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  45.67 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  52.69 
 
 		 637 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  43.48 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  44.57 
 
 		 458 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  53.33 
 
 		 727 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  52.29 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  54.22 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  50.49 
 
 		 924 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  43.01 
 
 		 787 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  44.09 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  44.09 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  52.83 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  41.3 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  41.3 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.52 
 
 		 729 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  40.22 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  39.13 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  39.13 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.58 
 
 		 795 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  40.22 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.72 
 
 		 1209 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  47.13 
 
 		 1121 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  51.14 
 
 		 1137 aa  72.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.86 
 
 		 6885 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  39.78 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.94 
 
 		 1448 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  38.04 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  50 
 
 		 2170 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  37.35 
 
 		 978 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 		 674 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  51.58 
 
 		 1017 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  41.76 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  41.94 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  37.89 
 
 		 2334 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  38.66 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  38.5 
 
 		 823 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  50 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.52 
 
 		 998 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  43.1 
 
 		 938 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  38.18 
 
 		 674 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  38.18 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  38.18 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  38.18 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  38.18 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  34.57 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  37.27 
 
 		 674 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  38.18 
 
 		 674 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  46.79 
 
 		 880 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  44.44 
 
 		 1221 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  45.45 
 
 		 973 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  37.27 
 
 		 674 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.32 
 
 		 1004 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10894  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0530773  normal  0.0659094 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  37.63 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  35.11 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  42.86 
 
 		 1916 aa  63.9  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  41.76 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  37.89 
 
 		 1238 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  48.94 
 
 		 1213 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  37.27 
 
 		 674 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>