31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2358 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  100 
 
 		 727 aa  1429    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  49.58 
 
 		 845 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  33.28 
 
 		 609 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  34.07 
 
 		 614 aa  256  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  33.61 
 
 		 633 aa  227  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  26.99 
 
 		 670 aa  147  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  30.95 
 
 		 667 aa  122  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  30.45 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  24.42 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 		 830 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.36 
 
 		 1746 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  28.9 
 
 		 4953 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  34.72 
 
 		 835 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  37.58 
 
 		 821 aa  62.4  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  26.2 
 
 		 2358 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  25.99 
 
 		 2296 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  28.41 
 
 		 2620 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  26.74 
 
 		 5337 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  25.78 
 
 		 2367 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  25.78 
 
 		 2358 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  25.78 
 
 		 2383 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  30.87 
 
 		 1237 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  27.59 
 
 		 2933 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  36.7 
 
 		 807 aa  50.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  35.24 
 
 		 851 aa  50.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  34.71 
 
 		 837 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  25 
 
 		 676 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  28.8 
 
 		 2933 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  33.96 
 
 		 1224 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  33.96 
 
 		 1224 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  29.34 
 
 		 1084 aa  44.3  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>