27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0328 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  100 
 
 
830 aa  1620    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  31.28 
 
 
614 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  27.2 
 
 
727 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  28.85 
 
 
633 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.32 
 
 
2367 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  29.08 
 
 
2296 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.32 
 
 
2358 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.32 
 
 
2383 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  29.14 
 
 
2358 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  28.38 
 
 
670 aa  65.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  28.35 
 
 
2620 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  28.28 
 
 
609 aa  61.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  33.55 
 
 
562 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  27.24 
 
 
1084 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  31.27 
 
 
2933 aa  55.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.79 
 
 
845 aa  55.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  27.62 
 
 
1976 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  30.62 
 
 
5337 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.81 
 
 
2795 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  29.02 
 
 
4953 aa  52.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  27.99 
 
 
1746 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  31.66 
 
 
2933 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.49 
 
 
1237 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  26.09 
 
 
535 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  28.26 
 
 
667 aa  47.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  30.17 
 
 
4672 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.37 
 
 
636 aa  45.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>