52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02355 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  100 
 
 		 845 aa  1657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  49.58 
 
 		 727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  32.47 
 
 		 609 aa  260  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  36.76 
 
 		 633 aa  244  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  32.53 
 
 		 614 aa  242  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  29.37 
 
 		 670 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  27.44 
 
 		 667 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  32.39 
 
 		 1237 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  27.38 
 
 		 1224 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  27.38 
 
 		 1224 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  30.4 
 
 		 835 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  32.6 
 
 		 1224 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  36.78 
 
 		 1209 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  34.36 
 
 		 562 aa  92.8  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  35.63 
 
 		 1209 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  29.2 
 
 		 818 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  30.75 
 
 		 821 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  28.5 
 
 		 820 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  28.18 
 
 		 535 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  27.64 
 
 		 851 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  26.96 
 
 		 2358 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  26.07 
 
 		 2383 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  29.78 
 
 		 837 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2367 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  26.07 
 
 		 2358 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  26.07 
 
 		 2296 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  26.11 
 
 		 2620 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  29.03 
 
 		 838 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  33.73 
 
 		 1417 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  28.47 
 
 		 4953 aa  72  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  26.68 
 
 		 807 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  30.74 
 
 		 1396 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  33.46 
 
 		 1418 aa  67  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  32.28 
 
 		 1417 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  32.28 
 
 		 1417 aa  64.7  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  24.55 
 
 		 1084 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  26.76 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  24.09 
 
 		 1746 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  27.58 
 
 		 2933 aa  55.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  29.73 
 
 		 934 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  26.26 
 
 		 5337 aa  51.2  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  24.3 
 
 		 1279 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 		 676 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  25.41 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 1050 aa  48.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  24.8 
 
 		 819 aa  48.5  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  23.44 
 
 		 811 aa  48.5  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  25.41 
 
 		 1075 aa  48.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  25.18 
 
 		 2795 aa  48.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  29.22 
 
 		 830 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  28.38 
 
 		 2933 aa  44.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  36.43 
 
 		 817 aa  44.3  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>