77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4116 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  100 
 
 		 2933 aa  5723    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  78.41 
 
 		 4953 aa  3497    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  34.5 
 
 		 2795 aa  842    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  79.72 
 
 		 5337 aa  3534    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  39.02 
 
 		 1976 aa  773    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  29.1 
 
 		 2296 aa  546  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  38.27 
 
 		 1050 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  38.14 
 
 		 1075 aa  486  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  38.27 
 
 		 1075 aa  486  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  33.51 
 
 		 1417 aa  478  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.05 
 
 		 1417 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  35.12 
 
 		 2933 aa  475  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  43.01 
 
 		 969 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  43.17 
 
 		 941 aa  473  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  33.41 
 
 		 1396 aa  473  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  30.12 
 
 		 1746 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  32.79 
 
 		 1418 aa  467  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  32.59 
 
 		 1417 aa  464  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  37.39 
 
 		 1084 aa  436  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  42.18 
 
 		 2367 aa  431  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  41.98 
 
 		 2358 aa  429  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  42.18 
 
 		 2383 aa  431  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  40.53 
 
 		 2358 aa  427  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  41.58 
 
 		 2620 aa  422  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  36.71 
 
 		 934 aa  362  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  38.66 
 
 		 730 aa  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  38.66 
 
 		 730 aa  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  38.66 
 
 		 730 aa  293  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  46.81 
 
 		 730 aa  290  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  36.14 
 
 		 724 aa  283  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  38.66 
 
 		 730 aa  282  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  44.76 
 
 		 410 aa  281  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  52.65 
 
 		 295 aa  253  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  52.65 
 
 		 292 aa  253  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  37.31 
 
 		 690 aa  225  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  33.51 
 
 		 497 aa  218  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.55 
 
 		 468 aa  201  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  33.97 
 
 		 464 aa  199  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  36.36 
 
 		 660 aa  198  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  31.3 
 
 		 509 aa  197  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  37.05 
 
 		 660 aa  196  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  31.3 
 
 		 474 aa  196  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  31.3 
 
 		 474 aa  196  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  37.41 
 
 		 660 aa  196  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  33.7 
 
 		 464 aa  196  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  33.7 
 
 		 464 aa  195  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  33.52 
 
 		 464 aa  195  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.47 
 
 		 476 aa  195  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  36.69 
 
 		 660 aa  195  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  36.36 
 
 		 660 aa  194  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.47 
 
 		 476 aa  194  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  30.79 
 
 		 474 aa  194  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  33.7 
 
 		 417 aa  194  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  33.7 
 
 		 417 aa  194  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  31.46 
 
 		 474 aa  193  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  33.42 
 
 		 464 aa  192  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  29.13 
 
 		 4672 aa  119  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  26.26 
 
 		 1459 aa  101  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  25.07 
 
 		 543 aa  90.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  27.29 
 
 		 3209 aa  72.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  41.24 
 
 		 974 aa  65.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  41.24 
 
 		 974 aa  65.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 980 aa  64.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  40 
 
 		 979 aa  65.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  40 
 
 		 980 aa  65.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 980 aa  63.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0979  Ig domain-containing protein  25.83 
 
 		 1630 aa  58.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.46 
 
 		 845 aa  57.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  33.46 
 
 		 633 aa  57.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4857  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1112 aa  55.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  30.22 
 
 		 614 aa  53.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1164 aa  52.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.17 
 
 		 1771 aa  51.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  29.43 
 
 		 609 aa  51.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.63 
 
 		 1152 aa  50.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2976  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1304 aa  47  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  25.2 
 
 		 302 aa  46.2  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>