80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2782 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  40.7 
 
 		 2795 aa  905    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  100 
 
 		 4672 aa  8552    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  38.54 
 
 		 1976 aa  585  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  30.75 
 
 		 4953 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  31.79 
 
 		 5337 aa  414  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  27.7 
 
 		 2933 aa  282  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  35.93 
 
 		 3209 aa  246  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  29.66 
 
 		 2933 aa  236  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  31.04 
 
 		 1417 aa  212  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  31.2 
 
 		 1418 aa  205  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1164 aa  203  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  31.75 
 
 		 1396 aa  203  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  29.44 
 
 		 1417 aa  196  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  31.41 
 
 		 1417 aa  194  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.98 
 
 		 2456 aa  184  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.97 
 
 		 2625 aa  182  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  25.67 
 
 		 2620 aa  180  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 		 3439 aa  180  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  27.18 
 
 		 2358 aa  179  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  26.65 
 
 		 2358 aa  178  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  27.24 
 
 		 2383 aa  179  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  27.24 
 
 		 2367 aa  178  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  26.29 
 
 		 2296 aa  176  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.46 
 
 		 1746 aa  146  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  28.02 
 
 		 3923 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  35.33 
 
 		 1084 aa  112  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  37.55 
 
 		 690 aa  102  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  37.55 
 
 		 941 aa  101  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  37.55 
 
 		 969 aa  101  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.98 
 
 		 3314 aa  100  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  26.91 
 
 		 8064 aa  99.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07116  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  92.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 2704 aa  88.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  30.37 
 
 		 5451 aa  85.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.24 
 
 		 4106 aa  81.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  28.53 
 
 		 6310 aa  81.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  43.45 
 
 		 747 aa  81.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 3230 aa  80.5  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.45 
 
 		 3552 aa  79.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.05 
 
 		 2402 aa  77.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 1050 aa  75.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  32.39 
 
 		 1075 aa  75.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  32.45 
 
 		 1075 aa  75.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.46 
 
 		 3739 aa  72  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.46 
 
 		 3824 aa  71.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.46 
 
 		 3824 aa  71.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.74 
 
 		 3721 aa  70.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  35.09 
 
 		 3562 aa  70.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03680  hypothetical protein  56.25 
 
 		 726 aa  68.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  30.33 
 
 		 3824 aa  69.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03690  hypothetical protein  56.25 
 
 		 729 aa  68.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.635781  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  28.84 
 
 		 1002 aa  68.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  41.56 
 
 		 4430 aa  67  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  27.48 
 
 		 1361 aa  65.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4373  hypothetical protein  28.75 
 
 		 654 aa  61.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.735451  normal  0.0116969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1278 aa  58.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.04 
 
 		 1597 aa  59.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4223  hypothetical protein  29.04 
 
 		 664 aa  57.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.8 
 
 		 1829 aa  57.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  48 
 
 		 1822 aa  57  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4356  hypothetical protein  29.41 
 
 		 663 aa  56.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.032963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.75 
 
 		 800 aa  56.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4379  hypothetical protein  29.04 
 
 		 664 aa  55.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  34.75 
 
 		 4748 aa  55.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  41.94 
 
 		 888 aa  52.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  27.46 
 
 		 807 aa  52.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.08 
 
 		 3325 aa  52  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 2346 aa  51.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.02 
 
 		 3168 aa  51.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  38 
 
 		 635 aa  51.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  29 
 
 		 819 aa  50.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  42.25 
 
 		 5080 aa  50.8  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  29.77 
 
 		 676 aa  50.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  27.62 
 
 		 837 aa  48.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.34 
 
 		 4836 aa  49.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.69 
 
 		 2839 aa  48.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1019 aa  47.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.74 
 
 		 1279 aa  47  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  29.58 
 
 		 638 aa  47  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.79 
 
 		 774 aa  46.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>