20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3244 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 1829 aa  3580    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  84.46 
 
 		 1822 aa  2886    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  30.65 
 
 		 1716 aa  270  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.9 
 
 		 717 aa  131  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.11 
 
 		 711 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.91 
 
 		 1800 aa  130  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1439 aa  112  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1439 aa  94.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1315 aa  87.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  30.24 
 
 		 631 aa  75.9  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.62 
 
 		 2281 aa  67.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1980 aa  57  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1238 aa  55.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  45.98 
 
 		 4672 aa  55.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  26.17 
 
 		 755 aa  52.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1193 aa  49.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  25.33 
 
 		 8918 aa  48.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.08 
 
 		 1710 aa  46.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.26 
 
 		 510 aa  45.8  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.23 
 
 		 594 aa  45.4  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>