117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0806 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  100 
 
 		 6310 aa  11840    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2456 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  95.1 
 
 		 8064 aa  10800    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  34.16 
 
 		 2625 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  88.46 
 
 		 5451 aa  8651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  75.09 
 
 		 3923 aa  5117    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  30.67 
 
 		 3824 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  30.71 
 
 		 3824 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  30.57 
 
 		 3824 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.93 
 
 		 3721 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.41 
 
 		 3739 aa  596  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.05 
 
 		 6715 aa  543  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 		 3552 aa  514  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  33.89 
 
 		 2704 aa  405  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.24 
 
 		 3562 aa  388  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.06 
 
 		 4106 aa  250  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.94 
 
 		 3314 aa  225  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.42 
 
 		 3325 aa  221  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  27.39 
 
 		 4689 aa  211  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.67 
 
 		 2927 aa  196  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  28.93 
 
 		 4430 aa  149  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  24.59 
 
 		 5080 aa  140  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.66 
 
 		 5561 aa  121  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.9 
 
 		 5559 aa  119  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  24.93 
 
 		 5561 aa  117  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.31 
 
 		 5559 aa  117  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  24.76 
 
 		 5561 aa  117  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.82 
 
 		 4480 aa  114  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.29 
 
 		 2402 aa  108  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.61 
 
 		 4874 aa  103  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1278 aa  95.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  26.98 
 
 		 3204 aa  95.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.71 
 
 		 3038 aa  90.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1019 aa  87  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27.15 
 
 		 2911 aa  85.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  27.73 
 
 		 2202 aa  83.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.46 
 
 		 5098 aa  83.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  35.97 
 
 		 4672 aa  82  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  28.87 
 
 		 500 aa  78.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  25.59 
 
 		 3736 aa  77  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.34 
 
 		 1461 aa  73.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  25.17 
 
 		 3734 aa  73.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  29.71 
 
 		 1301 aa  70.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.77 
 
 		 1462 aa  70.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0284  hypothetical protein  30.99 
 
 		 347 aa  68.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000141879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  25.46 
 
 		 3925 aa  68.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  38.85 
 
 		 1706 aa  67.4  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2169  hypothetical protein  35.45 
 
 		 637 aa  65.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.225639  normal  0.195248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  30.68 
 
 		 3340 aa  65.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.92 
 
 		 2807 aa  64.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  27.62 
 
 		 2768 aa  63.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 888 aa  63.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1789 aa  63.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.38 
 
 		 898 aa  62.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 1867 aa  62  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.61 
 
 		 4334 aa  61.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 		 4836 aa  61.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 2537 aa  61.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.53 
 
 		 2507 aa  61.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.41 
 
 		 11716 aa  60.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33215  hypothetical serine rich protein  22.22 
 
 		 2156 aa  60.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.963879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27.22 
 
 		 913 aa  60.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 6683 aa  60.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 6662 aa  60.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  32.4 
 
 		 1286 aa  59.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  27 
 
 		 850 aa  59.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 6779 aa  60.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1207 aa  59.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  25.17 
 
 		 5444 aa  58.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.99 
 
 		 3586 aa  58.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.53 
 
 		 3954 aa  58.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.74 
 
 		 2839 aa  57.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  31.55 
 
 		 539 aa  57.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1196  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.31 
 
 		 3173 aa  57.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  27.95 
 
 		 4748 aa  57  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 		 2452 aa  57  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  30.75 
 
 		 959 aa  56.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  34.48 
 
 		 2329 aa  56.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1912  hypothetical protein  32.65 
 
 		 709 aa  55.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0466434  normal  0.0319715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  37.6 
 
 		 1141 aa  55.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  30.9 
 
 		 2825 aa  55.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  40 
 
 		 747 aa  55.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  33.57 
 
 		 906 aa  55.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 2346 aa  54.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  50 
 
 		 16311 aa  54.3  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  37.01 
 
 		 2890 aa  54.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 		 2478 aa  54.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 		 2198 aa  53.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  49.23 
 
 		 3508 aa  53.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.22 
 
 		 680 aa  53.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.61 
 
 		 1586 aa  53.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.89 
 
 		 3714 aa  52.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3434  metallophosphoesterase  22.67 
 
 		 1327 aa  52.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  35.66 
 
 		 4791 aa  52  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.95 
 
 		 4220 aa  52  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 		 1855 aa  51.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  26.21 
 
 		 1951 aa  50.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  28.7 
 
 		 4285 aa  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.89 
 
 		 6885 aa  50.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  32.14 
 
 		 663 aa  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>