67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33215 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_68232  hypothetical protein containing von Willebrand factor and highly repetitive sequences  43.07 
 
 		 2303 aa  641    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33215  hypothetical serine rich protein  100 
 
 		 2156 aa  3990    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.963879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.82 
 
 		 681 aa  102  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50278  hyphally regulated cell wall protein  31.45 
 
 		 399 aa  100  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91284  hypothetical protein  29.85 
 
 		 555 aa  86.7  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_17474  hyphally regulated cell wall protein  28.71 
 
 		 580 aa  83.2  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_17369  hyphally regulated cell wall protein Exo-alpha-sialidase  29.25 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_17616  hyphally regulated cell wall protein  30.52 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79415  hyphally regulated cell wall protein  30.9 
 
 		 501 aa  81.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61722  hyphally regulated cell wall protein  30.62 
 
 		 408 aa  81.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_3255  hyphally regulated cell wall protein  30.94 
 
 		 397 aa  80.5  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_3529  hyphally regulated cell wall protein  29.53 
 
 		 392 aa  76.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75853  hyphally regulated cell wall protein  28.06 
 
 		 416 aa  72  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30195  hypothetical protein, likely cell wall localized and GPI-anchored mucin like  34.18 
 
 		 812 aa  72  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322783 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28950  Mucin-like not chitinase - possible cell wall mannoprotein  40.35 
 
 		 1978 aa  70.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.82 
 
 		 597 aa  68.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43205  hypothetical protein  29.83 
 
 		 411 aa  68.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64492  hyphally regulated cell wall protein  29.93 
 
 		 382 aa  66.6  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  36.67 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  22.96 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50059  hyphally regulated cell wall protein  28.69 
 
 		 473 aa  61.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1057  hypothetical protein  49.18 
 
 		 185 aa  56.6  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00747978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0869  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  24.14 
 
 		 662 aa  54.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  23.75 
 
 		 656 aa  54.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.99 
 
 		 574 aa  54.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271484  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_3402  hyphally regulated cell wall protein  25.66 
 
 		 409 aa  53.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26 
 
 		 2456 aa  52.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.23 
 
 		 653 aa  52.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 		 656 aa  52.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0936  hypothetical protein  53.7 
 
 		 190 aa  52.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  22.98 
 
 		 561 aa  51.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  20.38 
 
 		 656 aa  50.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8004  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1587 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.65 
 
 		 630 aa  50.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.65 
 
 		 630 aa  50.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  22.41 
 
 		 527 aa  50.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  21.19 
 
 		 698 aa  50.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.35 
 
 		 560 aa  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.48 
 
 		 625 aa  50.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.35 
 
 		 700 aa  50.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.37 
 
 		 561 aa  49.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.53 
 
 		 674 aa  49.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  20.75 
 
 		 546 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.97 
 
 		 561 aa  49.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20 
 
 		 630 aa  49.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.01 
 
 		 546 aa  49.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  21.01 
 
 		 546 aa  49.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  21.01 
 
 		 546 aa  49.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2625 aa  49.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  22.45 
 
 		 568 aa  48.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  20.46 
 
 		 630 aa  48.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  20.75 
 
 		 546 aa  48.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.11 
 
 		 561 aa  48.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.85 
 
 		 573 aa  48.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.43 
 
 		 566 aa  48.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.15 
 
 		 639 aa  48.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.09 
 
 		 566 aa  47.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.26 
 
 		 561 aa  47.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  20.75 
 
 		 470 aa  47.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.38 
 
 		 675 aa  47  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.3 
 
 		 673 aa  46.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.39 
 
 		 540 aa  46.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.43 
 
 		 568 aa  46.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  22.31 
 
 		 566 aa  46.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.92 
 
 		 608 aa  46.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.11 
 
 		 559 aa  46.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.83 
 
 		 670 aa  45.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>