81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1696 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
1586 aa  3133    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  43.8 
 
 
5080 aa  228  8e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  29.78 
 
 
1808 aa  159  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.25 
 
 
4106 aa  136  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  54.07 
 
 
1073 aa  135  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  39.47 
 
 
3739 aa  122  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  39.47 
 
 
3721 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  39.47 
 
 
3824 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  42.4 
 
 
3824 aa  119  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  39.04 
 
 
3824 aa  119  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  42.26 
 
 
981 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.36 
 
 
3552 aa  108  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
2704 aa  104  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  39.6 
 
 
3325 aa  101  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  37.81 
 
 
2927 aa  94.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  35.35 
 
 
3562 aa  92.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  35.53 
 
 
1278 aa  92.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  27.5 
 
 
1538 aa  90.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  36.41 
 
 
959 aa  90.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  41.32 
 
 
657 aa  89  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  32.54 
 
 
5559 aa  88.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  32.54 
 
 
5561 aa  88.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  32.54 
 
 
5559 aa  88.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  31.84 
 
 
5561 aa  87  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  32.06 
 
 
5561 aa  87  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  31.63 
 
 
2911 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  31.63 
 
 
3204 aa  85.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.64 
 
 
3314 aa  73.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0568  hypothetical protein  34.5 
 
 
1766 aa  72.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.16 
 
 
4430 aa  70.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.78 
 
 
2456 aa  69.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.02 
 
 
3758 aa  68.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  34.97 
 
 
2625 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  45.68 
 
 
5171 aa  62.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  31.18 
 
 
1787 aa  62.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  32.42 
 
 
1869 aa  60.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  34.1 
 
 
3923 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  37.06 
 
 
527 aa  58.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  30.94 
 
 
6779 aa  58.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.7 
 
 
2198 aa  58.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 
6683 aa  57  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 
6662 aa  57  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  34.58 
 
 
2524 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0567  hypothetical protein  26.09 
 
 
627 aa  55.5  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  39.47 
 
 
1350 aa  54.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  37.6 
 
 
1806 aa  55.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  30.37 
 
 
747 aa  55.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  35.25 
 
 
4854 aa  54.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 
1286 aa  53.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  32.61 
 
 
8064 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  32.61 
 
 
6310 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  27.38 
 
 
747 aa  52.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.54 
 
 
2402 aa  52.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  32.38 
 
 
5451 aa  52  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.53 
 
 
2839 aa  52  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  33.13 
 
 
414 aa  52  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  35.59 
 
 
2542 aa  52  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  30.7 
 
 
2887 aa  52  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  38.3 
 
 
1597 aa  51.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  35.26 
 
 
692 aa  50.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.69 
 
 
2812 aa  51.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.67 
 
 
4800 aa  50.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.74 
 
 
15831 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.88 
 
 
3516 aa  50.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
3954 aa  49.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  30.39 
 
 
1092 aa  50.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.72 
 
 
7149 aa  49.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  32.14 
 
 
14829 aa  49.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  32.47 
 
 
739 aa  49.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  31.22 
 
 
1529 aa  48.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0010  hypothetical protein  32.26 
 
 
178 aa  48.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  28.57 
 
 
635 aa  48.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  29.27 
 
 
2329 aa  48.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  29.91 
 
 
1141 aa  48.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 
4678 aa  48.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  26.38 
 
 
10203 aa  47.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  29.84 
 
 
4689 aa  47  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  28.89 
 
 
606 aa  46.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  30.25 
 
 
1424 aa  45.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.48 
 
 
2807 aa  45.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  24.04 
 
 
322 aa  45.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>