165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2063 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  93.42 
 
 
2911 aa  4764    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  100 
 
 
3204 aa  6248    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.8 
 
 
4106 aa  598  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  33.27 
 
 
3562 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  33.63 
 
 
3325 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  31.6 
 
 
3739 aa  513  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  31.42 
 
 
3824 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  31.37 
 
 
3824 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.53 
 
 
3824 aa  507  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  31.11 
 
 
3721 aa  494  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.88 
 
 
3552 aa  441  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  37.99 
 
 
2927 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  32.2 
 
 
4430 aa  414  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 
2704 aa  396  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.75 
 
 
5561 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.71 
 
 
5559 aa  374  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.53 
 
 
5561 aa  374  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.67 
 
 
5559 aa  374  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.67 
 
 
5561 aa  370  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  31.73 
 
 
2625 aa  360  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  31.47 
 
 
2456 aa  358  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  30.07 
 
 
3516 aa  322  9e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 
6683 aa  295  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 
6662 aa  294  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  29.72 
 
 
6779 aa  292  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  24.63 
 
 
5080 aa  232  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 
7149 aa  211  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.25 
 
 
3734 aa  200  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.77 
 
 
3736 aa  198  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.87 
 
 
4480 aa  194  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.63 
 
 
1278 aa  193  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.83 
 
 
5839 aa  154  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.48 
 
 
4791 aa  151  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.56 
 
 
3314 aa  143  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  27.43 
 
 
5451 aa  134  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  27.52 
 
 
8064 aa  125  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.76 
 
 
5442 aa  123  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  27.96 
 
 
4689 aa  122  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.97 
 
 
5216 aa  122  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.44 
 
 
6310 aa  120  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  28.24 
 
 
3923 aa  119  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.65 
 
 
4874 aa  112  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.99 
 
 
3586 aa  97.1  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  26.89 
 
 
1461 aa  94.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  28.43 
 
 
6715 aa  92  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.63 
 
 
1586 aa  85.1  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.84 
 
 
2839 aa  84  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.26 
 
 
3323 aa  82.8  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  33.68 
 
 
635 aa  82.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.39 
 
 
2812 aa  82  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 
2507 aa  79  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  32.74 
 
 
1529 aa  79  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.02 
 
 
1597 aa  77.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2271  Hemolysin-type calcium-binding region  29.49 
 
 
272 aa  77.8  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.820331  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.68 
 
 
2802 aa  75.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.75 
 
 
1219 aa  75.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  34.5 
 
 
959 aa  75.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  31.08 
 
 
606 aa  73.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  27.8 
 
 
2768 aa  72  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  30.56 
 
 
3758 aa  70.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.43 
 
 
3391 aa  69.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  34.5 
 
 
1869 aa  67.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  35 
 
 
739 aa  65.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.31 
 
 
1526 aa  65.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.67 
 
 
5098 aa  62.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  38.12 
 
 
747 aa  61.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.49 
 
 
1695 aa  58.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  28.03 
 
 
500 aa  56.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.9 
 
 
1919 aa  55.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  26.17 
 
 
499 aa  55.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  28.63 
 
 
1792 aa  55.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  29.03 
 
 
352 aa  54.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  41.33 
 
 
1079 aa  53.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  65.22 
 
 
1217 aa  53.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  26.87 
 
 
1434 aa  53.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  31.2 
 
 
850 aa  53.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  45.57 
 
 
2537 aa  53.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.47 
 
 
1092 aa  52.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.71 
 
 
3038 aa  52.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  27.97 
 
 
2064 aa  52.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  23.91 
 
 
5899 aa  52  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.46 
 
 
11716 aa  52.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  26.82 
 
 
1301 aa  52  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 
7072 aa  51.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 
4451 aa  51.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 
534 aa  50.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  26.33 
 
 
621 aa  50.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  50 
 
 
942 aa  50.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 
4678 aa  51.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  55.81 
 
 
1394 aa  51.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.9 
 
 
588 aa  50.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.95 
 
 
1538 aa  50.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  37.89 
 
 
562 aa  50.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.03 
 
 
1096 aa  50.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25 
 
 
3822 aa  50.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  60.47 
 
 
448 aa  50.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  57.14 
 
 
867 aa  50.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.75 
 
 
2836 aa  50.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  27.37 
 
 
670 aa  49.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  52.38 
 
 
1164 aa  50.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>