More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1834 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  100 
 
 
867 aa  1707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  52.08 
 
 
813 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  46.63 
 
 
709 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.02 
 
 
588 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.13 
 
 
1963 aa  115  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  44 
 
 
3619 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  44 
 
 
3619 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.33 
 
 
1236 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.29 
 
 
421 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.41 
 
 
2105 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  45.62 
 
 
946 aa  105  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.68 
 
 
950 aa  104  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46 
 
 
686 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  48.1 
 
 
833 aa  104  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  35.8 
 
 
942 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  46.76 
 
 
938 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  45.03 
 
 
1164 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  44.69 
 
 
1197 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  48.87 
 
 
2667 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.67 
 
 
3427 aa  101  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.63 
 
 
1795 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.87 
 
 
2885 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44 
 
 
1424 aa  99.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  50.91 
 
 
1022 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  45.71 
 
 
1017 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  48.36 
 
 
572 aa  98.6  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 
1895 aa  98.6  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.53 
 
 
982 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  47.62 
 
 
742 aa  97.8  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.35 
 
 
2954 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  34.76 
 
 
582 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  42.64 
 
 
757 aa  96.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.11 
 
 
2145 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  43.57 
 
 
303 aa  95.9  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  39.26 
 
 
795 aa  95.5  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42 
 
 
1287 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.31 
 
 
260 aa  95.5  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  41.38 
 
 
724 aa  95.1  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  47.97 
 
 
1175 aa  94.7  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.52 
 
 
219 aa  94.4  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.64 
 
 
606 aa  94.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.78 
 
 
518 aa  94.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.39 
 
 
3608 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  39.11 
 
 
475 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.4 
 
 
686 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 
219 aa  93.2  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.42 
 
 
3954 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  28.64 
 
 
1421 aa  92.8  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
243 aa  92  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  39.11 
 
 
475 aa  92  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  45.07 
 
 
639 aa  91.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  45.62 
 
 
2775 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  45.62 
 
 
1712 aa  91.3  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.83 
 
 
1279 aa  91.3  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  35.89 
 
 
4687 aa  91.3  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.5 
 
 
3209 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  38.81 
 
 
2329 aa  91.3  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  30.23 
 
 
769 aa  90.9  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
245 aa  90.9  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  39.86 
 
 
1538 aa  90.9  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  47.24 
 
 
280 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  47.24 
 
 
280 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.43 
 
 
4334 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  44.83 
 
 
355 aa  89.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  42.25 
 
 
232 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.58 
 
 
585 aa  90.1  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 
1079 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 
485 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  43.7 
 
 
4798 aa  89  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  37.04 
 
 
850 aa  89  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  39.23 
 
 
680 aa  89  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  57.14 
 
 
1699 aa  89  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.53 
 
 
485 aa  88.2  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.99 
 
 
833 aa  88.2  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  50.49 
 
 
561 aa  88.2  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  32.41 
 
 
679 aa  88.2  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  53.51 
 
 
4854 aa  87.8  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  44.74 
 
 
595 aa  87.8  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.82 
 
 
980 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  48.82 
 
 
202 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  48.82 
 
 
202 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
615 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.68 
 
 
2678 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.23 
 
 
2668 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.92 
 
 
1156 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  46.85 
 
 
1594 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.38 
 
 
2689 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  41.96 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.45 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  43.71 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  35.14 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 
744 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.95 
 
 
1145 aa  85.5  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  46.61 
 
 
1814 aa  85.1  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  41.34 
 
 
1499 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  40.69 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  40.94 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  49.09 
 
 
959 aa  84.3  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  41.72 
 
 
2911 aa  84.3  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>