128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  34.07 
 
 		 6310 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.83 
 
 		 4106 aa  767    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  100 
 
 		 2456 aa  4488    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  33.78 
 
 		 8064 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  87.51 
 
 		 2625 aa  3956    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  42.52 
 
 		 2704 aa  997    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  34.17 
 
 		 5451 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  33.48 
 
 		 3923 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  34.08 
 
 		 3739 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  37.9 
 
 		 3562 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  33.28 
 
 		 3721 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.38 
 
 		 3824 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  34.32 
 
 		 3824 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  34.41 
 
 		 3824 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.09 
 
 		 3552 aa  635  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  32.65 
 
 		 3325 aa  522  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.65 
 
 		 3314 aa  400  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.54 
 
 		 4430 aa  365  8e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  31.37 
 
 		 3204 aa  341  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.65 
 
 		 2927 aa  337  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.11 
 
 		 7149 aa  290  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  31.28 
 
 		 2911 aa  285  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.01 
 
 		 6715 aa  262  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.04 
 
 		 6683 aa  256  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 6662 aa  256  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.99 
 
 		 5080 aa  252  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.09 
 
 		 6779 aa  251  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.96 
 
 		 5561 aa  249  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.93 
 
 		 5561 aa  248  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.74 
 
 		 5559 aa  246  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.83 
 
 		 5559 aa  244  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.68 
 
 		 5561 aa  242  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.53 
 
 		 4689 aa  207  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  29.56 
 
 		 4672 aa  143  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 4678 aa  127  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1278 aa  121  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.86 
 
 		 4480 aa  120  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.76 
 
 		 1461 aa  118  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.49 
 
 		 4874 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.36 
 
 		 3925 aa  114  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33 
 
 		 2839 aa  111  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.46 
 
 		 3586 aa  108  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  24.88 
 
 		 2168 aa  105  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  21.08 
 
 		 9867 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  30.91 
 
 		 888 aa  100  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  29 
 
 		 500 aa  99  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  28.75 
 
 		 3516 aa  98.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1019 aa  96.3  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.06 
 
 		 898 aa  95.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.95 
 
 		 899 aa  89  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.23 
 
 		 4791 aa  88.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.58 
 
 		 5839 aa  80.9  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.81 
 
 		 2768 aa  77  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  28.03 
 
 		 850 aa  76.3  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  28.01 
 
 		 5442 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  34.22 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.16 
 
 		 3038 aa  71.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  37 
 
 		 747 aa  71.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33 
 
 		 11716 aa  70.1  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  26.43 
 
 		 1951 aa  69.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  34.05 
 
 		 1869 aa  69.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.19 
 
 		 16322 aa  69.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 1586 aa  69.3  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.65 
 
 		 800 aa  68.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.23 
 
 		 5098 aa  68.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  26.56 
 
 		 1787 aa  67.4  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  28.31 
 
 		 913 aa  66.6  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.42 
 
 		 5216 aa  66.6  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  29.62 
 
 		 4214 aa  66.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.82 
 
 		 2117 aa  66.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  38.98 
 
 		 635 aa  64.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  24.65 
 
 		 2110 aa  64.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 		 937 aa  63.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  34.52 
 
 		 959 aa  62  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  26.35 
 
 		 1699 aa  62.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  36.18 
 
 		 747 aa  61.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  36.36 
 
 		 714 aa  60.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1207 aa  60.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.7 
 
 		 1597 aa  58.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33215  hypothetical serine rich protein  25.79 
 
 		 2156 aa  58.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.963879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  44.55 
 
 		 4748 aa  58.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.63 
 
 		 1557 aa  57.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.14 
 
 		 2807 aa  58.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  34.92 
 
 		 2825 aa  57.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 1286 aa  57.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  26.46 
 
 		 322 aa  57.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  30.8 
 
 		 539 aa  57.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  30.97 
 
 		 2402 aa  56.6  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.59 
 
 		 2552 aa  55.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  34.11 
 
 		 4451 aa  55.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.86 
 
 		 2507 aa  55.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  33.57 
 
 		 1141 aa  55.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  27.41 
 
 		 711 aa  55.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 361 aa  54.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 7072 aa  54.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.13 
 
 		 824 aa  54.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  34.46 
 
 		 2329 aa  53.9  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1538 aa  53.5  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  21.86 
 
 		 1884 aa  53.5  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  26.86 
 
 		 906 aa  53.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>