52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3456 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
800 aa  1545    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  32.64 
 
 
823 aa  229  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.13 
 
 
696 aa  141  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  32.21 
 
 
3824 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  32.21 
 
 
3721 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  32.21 
 
 
3739 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  32.21 
 
 
3824 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  32.21 
 
 
3824 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  34.51 
 
 
3230 aa  74.3  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  33.65 
 
 
2456 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  27.71 
 
 
374 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  33.67 
 
 
392 aa  63.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  32.68 
 
 
496 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  33.66 
 
 
488 aa  63.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  27.8 
 
 
500 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  27.2 
 
 
507 aa  60.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  35.23 
 
 
2625 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.2 
 
 
3552 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.42 
 
 
380 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 
384 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 
381 aa  58.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  30.04 
 
 
503 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.19 
 
 
378 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  33.75 
 
 
4672 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  40.78 
 
 
522 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.18 
 
 
3562 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  31.33 
 
 
888 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  30.2 
 
 
3325 aa  54.7  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  27.33 
 
 
499 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  26.18 
 
 
522 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  30.67 
 
 
500 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  35.56 
 
 
747 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  29.85 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  25.5 
 
 
381 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  34.51 
 
 
6715 aa  52  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.22 
 
 
3314 aa  51.2  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.69 
 
 
4106 aa  50.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.05 
 
 
2704 aa  50.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  35.92 
 
 
501 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  40.74 
 
 
399 aa  48.9  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.04 
 
 
372 aa  48.5  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 
457 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  33.73 
 
 
7149 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  28.57 
 
 
344 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  32.29 
 
 
240 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.44 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  39.29 
 
 
1452 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  29.28 
 
 
2911 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  29.28 
 
 
3204 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  29.29 
 
 
349 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
220 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.48 
 
 
5080 aa  44.3  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>