41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7728 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  64.48 
 
 
499 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  63.29 
 
 
507 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  65.41 
 
 
500 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  100 
 
 
503 aa  1010    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  61.48 
 
 
500 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  59.24 
 
 
522 aa  591  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  50.49 
 
 
501 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  51.33 
 
 
374 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  49.02 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.7 
 
 
494 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  46.49 
 
 
381 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.61 
 
 
381 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.04 
 
 
372 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  45.18 
 
 
496 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  40.4 
 
 
522 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  41.23 
 
 
488 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.32 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 
378 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  40.12 
 
 
368 aa  226  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.58 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.69 
 
 
380 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.74 
 
 
368 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.7 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  34.63 
 
 
344 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.51 
 
 
220 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  35.05 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  33.12 
 
 
346 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  31.21 
 
 
392 aa  118  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  50.94 
 
 
727 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  38.29 
 
 
366 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  26.07 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0312  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.27 
 
 
484 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0978  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
514 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000974435  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.97 
 
 
800 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  29.76 
 
 
261 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.65 
 
 
222 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4484  S1E family peptidase  34.38 
 
 
136 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0979006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  27.32 
 
 
823 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  34.34 
 
 
217 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  33.96 
 
 
235 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>