49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0484 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  100 
 
 
368 aa  735    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  51.34 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.41 
 
 
381 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  44.35 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.08 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  43.73 
 
 
499 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  43.06 
 
 
522 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  42.55 
 
 
500 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  47.79 
 
 
501 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  42.09 
 
 
500 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  41.87 
 
 
507 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  41.33 
 
 
399 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  39.6 
 
 
503 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  44.58 
 
 
496 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  43.2 
 
 
488 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  43.14 
 
 
522 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.79 
 
 
378 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.31 
 
 
494 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.4 
 
 
368 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.58 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.9 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  39.88 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.24 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  39.81 
 
 
346 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  38.63 
 
 
344 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.28 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  36.84 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.64 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  26.55 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  37.59 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  28.46 
 
 
823 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  26.61 
 
 
494 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0366  hypothetical protein  31.36 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0821  hypothetical protein  34.03 
 
 
425 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2208  hypothetical protein  28.51 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000512489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  32.4 
 
 
372 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2627  hypothetical protein  32.39 
 
 
482 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1379  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.37 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0301547  normal  0.108575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  32.62 
 
 
240 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0488  hypothetical protein  35.09 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2479  hypothetical protein  26.64 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.18 
 
 
696 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4484  S1E family peptidase  31.03 
 
 
136 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0979006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  30.35 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.94 
 
 
222 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  30.82 
 
 
235 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.88 
 
 
800 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  31.21 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>