41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0531 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
222 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  60.2 
 
 
261 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  42.47 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  47.4 
 
 
235 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  39.18 
 
 
293 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.29 
 
 
372 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  34.5 
 
 
399 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 
380 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2890  hypothetical protein  30.63 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.87 
 
 
384 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2860  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2904  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685381  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  29.76 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  32.06 
 
 
500 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  32.35 
 
 
499 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  30.39 
 
 
522 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3416  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0466682  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4913  hypothetical protein  29.59 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  31.65 
 
 
503 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  30.37 
 
 
522 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  27.98 
 
 
374 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  26.7 
 
 
501 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  30.11 
 
 
507 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  25.63 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  28.44 
 
 
823 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  32.89 
 
 
496 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  25.63 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  25.63 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  27.63 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  29.44 
 
 
500 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  26.44 
 
 
392 aa  45.1  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  29.94 
 
 
368 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5525  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269094  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  28.65 
 
 
434 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  36.76 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0197  hypothetical protein  29.59 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.12 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.38 
 
 
696 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.97 
 
 
378 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3226  hypothetical protein  25.49 
 
 
221 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>