33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2955 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2955  peptidase  100 
 
 		 346 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  81.9 
 
 		 344 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  63.55 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.19 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  46.15 
 
 		 366 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  43.58 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  39.62 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  38.12 
 
 		 522 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  39.08 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  40.97 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 372 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.79 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  35.87 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  35.42 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.88 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  36 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  36.19 
 
 		 522 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  35.67 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  37.14 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 		 384 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  39.37 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  35.56 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  33.65 
 
 		 503 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.42 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.5 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.55 
 
 		 457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.21 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.33 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.83 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.68 
 
 		 800 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  41.94 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0366  hypothetical protein  28.72 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  36.96 
 
 		 217 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>