37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3387 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  42.75 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  37.79 
 
 		 293 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  38.46 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3226  hypothetical protein  30.81 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2890  hypothetical protein  31.41 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2860  hypothetical protein  31.09 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2904  hypothetical protein  31.09 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 		 380 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.54 
 
 		 522 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  26.67 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  26.67 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  32.62 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  26.67 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  29.49 
 
 		 503 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.29 
 
 		 800 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 488 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  30.64 
 
 		 823 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  30.57 
 
 		 399 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.85 
 
 		 372 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  30.18 
 
 		 496 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  27.23 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11845  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0197  hypothetical protein  27.84 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.27 
 
 		 696 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  30.34 
 
 		 374 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 		 381 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5525  hypothetical protein  27.68 
 
 		 227 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.62 
 
 		 494 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4913  hypothetical protein  27.95 
 
 		 238 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13699  protease  25.14 
 
 		 232 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0599341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0488  hypothetical protein  28.72 
 
 		 232 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1379  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.99 
 
 		 201 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0301547  normal  0.108575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  29.19 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>