48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  100 
 
 
381 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  51.05 
 
 
374 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.99 
 
 
372 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.72 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.45 
 
 
384 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  51.34 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  46.05 
 
 
499 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  53.22 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  46.19 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  44.13 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  44.62 
 
 
522 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  45.38 
 
 
507 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.59 
 
 
378 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  46.49 
 
 
503 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  46.2 
 
 
399 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  44.93 
 
 
522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  45.07 
 
 
488 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  45.97 
 
 
496 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.72 
 
 
368 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.13 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.73 
 
 
380 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.87 
 
 
457 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.77 
 
 
387 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  43.31 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  44.44 
 
 
344 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  44.05 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  35.13 
 
 
366 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.37 
 
 
220 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  35.6 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  23.53 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  24.31 
 
 
494 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0821  hypothetical protein  27.4 
 
 
425 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  30.62 
 
 
823 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.07 
 
 
800 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4484  S1E family peptidase  32.23 
 
 
136 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0979006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  30.88 
 
 
261 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  30.22 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6300  hypothetical protein  25.99 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1379  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.09 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0301547  normal  0.108575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.06 
 
 
696 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0366  hypothetical protein  28.57 
 
 
373 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0918  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 
271 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000713648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_906  serine protease, DegP/HtrA family  30.16 
 
 
251 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000453115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  30.15 
 
 
240 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1036  serine protease  27.44 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  25.82 
 
 
434 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>