143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1850 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  100 
 
 		 496 aa  1003    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  56.4 
 
 		 522 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  54.29 
 
 		 488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  45.7 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  45.45 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  43.77 
 
 		 499 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  43.92 
 
 		 522 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  47.74 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  44.65 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  41.32 
 
 		 507 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.41 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  46.94 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  40.73 
 
 		 500 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  41.88 
 
 		 500 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.02 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  44.97 
 
 		 368 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.42 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.33 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.39 
 
 		 494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.8 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.53 
 
 		 368 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  38.39 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  37.85 
 
 		 344 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  57.04 
 
 		 531 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  36.17 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.9 
 
 		 387 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  41.35 
 
 		 366 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  54.03 
 
 		 580 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.06 
 
 		 1072 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.25 
 
 		 392 aa  115  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  46.67 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  42.86 
 
 		 634 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 		 220 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  38.66 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  39.5 
 
 		 452 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.44 
 
 		 933 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  42.98 
 
 		 497 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  39.17 
 
 		 732 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  38.94 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35.9 
 
 		 489 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  38.26 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  35.65 
 
 		 1207 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  40.16 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  37.39 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 709 aa  84  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  38.05 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  36.21 
 
 		 374 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  38.76 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  37.5 
 
 		 1128 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  36.51 
 
 		 890 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.09 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  35.54 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  36.75 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  40.71 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  37.17 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  37.17 
 
 		 801 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  34.4 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.97 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.04 
 
 		 801 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  33.33 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.19 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  35 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  36.21 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.62 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  35.9 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 468 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  34.48 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  35.34 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.62 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  30.47 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  31.15 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  30.53 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.48 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.33 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.68 
 
 		 800 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  44.59 
 
 		 794 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  43.24 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  33.61 
 
 		 275 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.44 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.87 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  32.8 
 
 		 165 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.57 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  29.51 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  26.87 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  31.78 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  26.33 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  33.88 
 
 		 653 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  26.72 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.08 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.06 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.53 
 
 		 815 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 1016 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>