195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4911 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  100 
 
 
472 aa  959    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  67.16 
 
 
468 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  86.31 
 
 
490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  94.24 
 
 
801 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  85.51 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  87.4 
 
 
498 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  45.14 
 
 
289 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  48.35 
 
 
292 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  45.42 
 
 
323 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  77.52 
 
 
461 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  45 
 
 
298 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  45.45 
 
 
295 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  76.19 
 
 
451 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  41.95 
 
 
301 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  73.81 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  44.03 
 
 
311 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  37.65 
 
 
319 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  72.44 
 
 
547 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  45.55 
 
 
285 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  70.87 
 
 
500 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  43.64 
 
 
304 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  70.87 
 
 
380 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  39.08 
 
 
319 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  65.87 
 
 
374 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  61.42 
 
 
492 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  60.33 
 
 
558 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  61.67 
 
 
801 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  47.03 
 
 
603 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  52.2 
 
 
469 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  58.4 
 
 
535 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  59.2 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  50 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  57.85 
 
 
589 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  45.59 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  48.82 
 
 
497 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  46.21 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  45.83 
 
 
634 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  47.11 
 
 
803 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  44.23 
 
 
801 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  49.21 
 
 
568 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  43.07 
 
 
567 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  41.67 
 
 
890 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.07 
 
 
933 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45.45 
 
 
373 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  43.26 
 
 
479 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  38.57 
 
 
516 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.82 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.33 
 
 
1072 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  41.13 
 
 
642 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 
709 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  44.8 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  38.19 
 
 
494 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36.97 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  44.17 
 
 
384 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  44 
 
 
574 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  40.83 
 
 
732 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  40.58 
 
 
1207 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.64 
 
 
627 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  41.53 
 
 
417 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  39.34 
 
 
452 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  44.09 
 
 
824 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.99 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  39.84 
 
 
165 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  38.02 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  36.5 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.71 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  33.88 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  36.75 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.23 
 
 
1016 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  27.55 
 
 
436 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.3 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.33 
 
 
597 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.05 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.82 
 
 
491 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
756 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.81 
 
 
815 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  33.59 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  30.2 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.55 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36.09 
 
 
1128 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  39.29 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.33 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.31 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.23 
 
 
695 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 
495 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.65 
 
 
520 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  46.15 
 
 
569 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.1 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  32.14 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  32.59 
 
 
503 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  35.54 
 
 
1577 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 
571 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>