227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3106 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  100 
 
 		 548 aa  1107    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  67.17 
 
 		 597 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  50.75 
 
 		 568 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  47.9 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  48.26 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  45.39 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.37 
 
 		 558 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  44.34 
 
 		 541 aa  339  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  46.84 
 
 		 407 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.15 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  48.52 
 
 		 413 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  45.82 
 
 		 408 aa  323  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  45.76 
 
 		 693 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  45.06 
 
 		 403 aa  312  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.9 
 
 		 604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  43.72 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  40.38 
 
 		 408 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  42.79 
 
 		 399 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  43.17 
 
 		 387 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  37.18 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  39.95 
 
 		 727 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  33.56 
 
 		 589 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  38.1 
 
 		 850 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  35.83 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  35.61 
 
 		 535 aa  216  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  32.54 
 
 		 677 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  33.58 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 658 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  31.96 
 
 		 631 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  33.95 
 
 		 583 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  31.94 
 
 		 636 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.73 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.59 
 
 		 737 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  35.38 
 
 		 320 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  31.98 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.37 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.19 
 
 		 441 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30 
 
 		 640 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  54.47 
 
 		 374 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  30.02 
 
 		 427 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.02 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.79 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  50.75 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  53.85 
 
 		 801 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  49.65 
 
 		 492 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  28.05 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  51.15 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  27.13 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  31.99 
 
 		 587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  51.22 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  50.81 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  47.2 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.8 
 
 		 498 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  39.89 
 
 		 490 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  48.36 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  27.04 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.48 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  44.78 
 
 		 801 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  28.5 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  47.73 
 
 		 368 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.83 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.6 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  46.4 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  47.2 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  45.6 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  27.65 
 
 		 445 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.8 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  27.42 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.51 
 
 		 440 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  28.7 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  40.49 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44.44 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  44.85 
 
 		 516 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.4 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  38.85 
 
 		 803 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.82 
 
 		 476 aa  97.8  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40.52 
 
 		 634 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  42.06 
 
 		 709 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.78 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  44.44 
 
 		 801 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.26 
 
 		 933 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  42.98 
 
 		 446 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  42.31 
 
 		 358 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.61 
 
 		 890 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 1072 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.19 
 
 		 384 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.11 
 
 		 627 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  34.5 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  42.24 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  42.74 
 
 		 732 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  37.86 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  39.32 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.69 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  37.72 
 
 		 1207 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.83 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.79 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  39.5 
 
 		 1128 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>