51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3830 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  69.62 
 
 
323 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  66.01 
 
 
289 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  62.41 
 
 
311 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  65.59 
 
 
292 aa  342  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  66.54 
 
 
304 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  60.53 
 
 
301 aa  332  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  68.38 
 
 
285 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  60.53 
 
 
319 aa  325  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  53.6 
 
 
319 aa  301  8.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  58.4 
 
 
295 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  45 
 
 
472 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  44.66 
 
 
468 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  28.8 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  27.48 
 
 
451 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.07 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  34.23 
 
 
506 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  29.91 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  26.85 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 
261 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.6 
 
 
305 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 
281 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  29.13 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.13 
 
 
464 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  27.27 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  21.48 
 
 
456 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.32 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  35.29 
 
 
501 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  23.36 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.7 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  29.57 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32 
 
 
467 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  21.09 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  30.82 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  24.86 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  28.03 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.53 
 
 
771 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.53 
 
 
767 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  24.73 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  24.53 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.83 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  28.46 
 
 
1010 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6609  hypothetical protein  21.09 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234313  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  26.49 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  30.63 
 
 
763 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  20.72 
 
 
382 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  30.63 
 
 
763 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  30.63 
 
 
763 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  27.93 
 
 
337 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>